Valentin Loux
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Valentin Loux
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Valentin Loux @vloux.bsky.social · 15h
Activation immédiate du plan grand froid et refonte sur le long terme des places « d’urgence » pour sortir les précaires de la rue !

vloux.bsky.social
Valentin Loux @vloux.bsky.social · 15h
« Ne prendre en charge les femmes enceintes que si elles sont dans leur huitième mois de grossesse et ne prendre en charge que les familles avec des enfants [de]moins de trois mois »
Face a la pénurie l’indigence des critères d’attribution de places au 115.

www.franceinfo.fr/societe/pauv...
Face à l'épisode de froid, "il est de l'intérêt des enfants que le plan grand froid soit déclenché" à Paris, réclame la Défenseure des enfants de la Ville
Quelque 23 départements ont déjà activé ce plan qui permet de mettre en place davantage de dispositifs d'urgence pour les personnes les plus vulnérables à la rue.
www.franceinfo.fr

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galaxytraining.bsky.social
GTN @galaxytraining.bsky.social · 8d
Save the date: The Galaxy Training Academy 2026 will happen from May 18th to May 22th

Read more at https://training.galaxyproject.org/training-material/news/2025/11/13/gta-date-2026.html

@galaxyproject.bsky.social

vloux.bsky.social
Valentin Loux @vloux.bsky.social · 9d
« Les salariés du 115 ont le sentiment d’être en première ligne face à un système grippé de l’intérieur »
En Seine Saint-Denis comme ailleurs. Tellement de demandes, si peu de places ….
liberation.fr Libération @liberation.fr · 9d
«Des situations désespérées auxquelles on ne peut pas répondre» : les écoutants du 115 de Seine-Saint-Denis en grève

Le 15 décembre, sur 547 appels, dont beaucoup de femmes et de familles avec jeunes enfants, seules 4 personnes ont été mises à l’abri.
«Des situations désespérées auxquelles on ne peut pas répondre» : les écoutants du 115 de Seine-Saint-Denis en grève
Le 115 de Seine-Saint-Denis, porté par le réseau Interlogement93, débraye jusqu’au 18 décembre pour exiger de meilleures politiques publiques en matière d’accueil et d’hébergement des plus précaires.
www.liberation.fr

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liberation.fr
Libération @liberation.fr · 9d
«Des situations désespérées auxquelles on ne peut pas répondre» : les écoutants du 115 de Seine-Saint-Denis en grève

Le 15 décembre, sur 547 appels, dont beaucoup de femmes et de familles avec jeunes enfants, seules 4 personnes ont été mises à l’abri.
«Des situations désespérées auxquelles on ne peut pas répondre» : les écoutants du 115 de Seine-Saint-Denis en grève
Le 115 de Seine-Saint-Denis, porté par le réseau Interlogement93, débraye jusqu’au 18 décembre pour exiger de meilleures politiques publiques en matière d’accueil et d’hébergement des plus précaires.
www.liberation.fr

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lemonde.fr
Le Monde @lemonde.fr · 9d
A Paris, le nombre de sans-abri dans les campements au plus haut depuis six ans
A Paris, le nombre de sans-abri dans les campements au plus haut depuis six ans
Les maraudes de France terre d’asile ont recensé, fin novembre, 663 tentes dans les principales zones de campements de la capitale, ce qui représenterait 985 à 1 723 personnes. En cause, la baisse des places d’hébergements et les restrictions dans l’accès au séjour.
www.lemonde.fr

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jcamthrash.bsky.social
Cameron Thrash @jcamthrash.bsky.social · 10d
Gempipe: a tool for drafting, curating, and analyzing pan and multi-strain genome-scale metabolic models journals.asm.org/doi/full/10.... #jcampubs

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torstenseemann.bsky.social
Torsten Seemann @torstenseemann.bsky.social · 11d
💾 Prokka 1.15.6 is released!

This is the last major release of Prokka. But don't be sad, because @oschwengers.bsky.social already has an excellent replacement called Bakta you can migrate to.
#bioinformatics #microbiology #genomics

github.com/tseemann/pro...
Release Heading into the sunset · tseemann/prokka
The future This is probably the last release of Prokka. I won't be making any code changes except bug fixes. I will update the databases occasionally. I strongly recommend you use Bakta by @oschwen...
github.com

vloux.bsky.social
Valentin Loux @vloux.bsky.social · 22d
Trois jours d’échanges riches sur la structuration de la bioinformatique en France et les nombreux défis stratégique : IA, ouverture des données, accompagnement des communautés , gestion des donnes sensibles …
inrae-migale.bsky.social INRAE Migale @inrae-migale.bsky.social · 23d
Nous sommes bien là ;)
ifb-elixir-fr.bsky.social IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 23d
📣🚀✨Toutes nos équipes et plateformes sont réunies depuis hier pour cette nouvelle édition du All-Hands IFB/ELIXIR-FR 2025 !
#ElixirFR25

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inrae-maiage.bsky.social
Unité INRAE MaIAGE @inrae-maiage.bsky.social · 22d
Nous y étions et avons participé activement aux FROGSDays 2025 ✨, un rendez-vous marqué par le partage 🤝, l’innovation 🔬 et les échanges autour du métabarcoding microbien.

Plus d'information : lnkd.in/d3A7qN4n

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INRAE Migale @inrae-migale.bsky.social · 23d
Nous sommes bien là ;)
ifb-elixir-fr.bsky.social IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 23d
📣🚀✨Toutes nos équipes et plateformes sont réunies depuis hier pour cette nouvelle édition du All-Hands IFB/ELIXIR-FR 2025 !
#ElixirFR25

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inrae-migale.bsky.social
INRAE Migale @inrae-migale.bsky.social · 23d
Migale est partie prenante des #FROGS Days (1-3/12/25), pour célébrer les 10 ans de l’outils #FROGS pour l’analyse de données de metabarcoding. @cmidoux.bsky.social @mahendram.bsky.social et Olivier Rué y présentent certaines de nos contributions.

👉 frogsdays.symposium.inrae.fr

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ifb-elixir-fr.bsky.social
IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 23d
📣🚀✨Toutes nos équipes et plateformes sont réunies depuis hier pour cette nouvelle édition du All-Hands IFB/ELIXIR-FR 2025 !
#ElixirFR25

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podlesny.bsky.social
Daniel Podlesny @podlesny.bsky.social · 24d
We're excited to release metaTraits.embl.de! 🦠 Interactively explore 140+ 𝗺𝗶𝗰𝗿𝗼𝗯𝗶𝗮𝗹 𝗽𝗵𝗲𝗻𝗼𝘁𝘆𝗽𝗶𝗰 𝘁𝗿𝗮𝗶𝘁𝘀, harmonized & integrated from culture-derived collections 🔬 & genome-based predictions 🧬 for >2M MAGs & genomes.

Publication at NAR: doi.org/10.1093/nar/... @narjournal.bsky.social #microsky 🧵 1/8

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bearstech.com
Bearstech @bearstech.com · 25d
Le calendrier de l'Avent de SadServers.

Advent of Sysadmin 2025, la version sysadmin de l'Advent of Code, avec des serveurs tristes. (P+Lu)

👉 sadservers.com/advent
Advent of Sysadmin 2025 The Advent of Sysadmin is a 12-day Advent calendar of Linux and DevOps challenges of different difficulties that runs from December 1st to December 12th. Each day there will be an Advent of Sysadmin scenario. Sign up for a free account (needed to keep track of your progress) and start solving the scenarios! If you want to check out a scenario without signing up, you can run this one that requires no registration: Day Name Level Time Limit 2025-12-01 "Auderghem": containers miscommunication Easy 15 mins "Auderghem": containers miscommunication Scenario: "Auderghem": containers miscommunication Level: Easy Type: Fix Tags: nginx Access: Email Description: There is an nginx Docker container that listens on port 80, the purpose of which is to redirect the traffic to two other containers statichtml1 and statichtml2 but this redirection is not working. Fix the problem. IMPORTANT. You can restart all containers, but don't stop or remove them. Root (sudo) Access: True Test: The nginx container must redirect the traffic to the statichtml1 and statichtml2 containers: curl http://localhost returns the Welcome to nginx default page curl http://localhost/1 returns HelloWorld;1 curl http://localhost/2 returns HelloWorld;2 The "Check My Solution" button runs the script /home/admin/agent/check.sh, which you can see and execute. Time to Solve: 15 minutes.

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chloebaum.bsky.social
Chloé Baum @chloebaum.bsky.social · 25d
📢 Registration for the Nanopore Users Day 2026 is now OPEN!
Registration is free but mandatory

🗓️ 10 March 2026
📍Institut Pasteur Paris
Make sure to secure your spot, see you there!

👉 www.eventbrite.com/e/billets-na...

@chcrestani.bsky.social @pasteur.fr @nanoporetech.com @nebiolabs.bsky.social

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IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 28d
📢🚀💻Le nouveau site internet de l’IFB/ELIXIR-FR est en ligne !!!
Lancé début 2025, le projet de refonte/création du nouveau site internet de l’IFB/ELIXIR-FR atteint aujourd’hui l’une de ses étapes cruciales : sa publication ! www.ifb-elixir.fr

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bearstech.com
Bearstech @bearstech.com · Nov 20
Campagne de dons 2026 de Framasoft, un objectif de 250 000 € pour soutenir l'usage numérique éthique de 2 millions de bénéficiaires.

❤️ Pour soutenir l'association 👉 soutenir.framasoft.o...
Soutenez notre campagne 2026 ! Framasoft maintient et fournit de nombreux services en ligne (Framadate, Framapad, Framaspace, etc). Ces services, ainsi que toutes nos actions s'ancrent dans notre mission : permettre l'existence d'un numérique robuste et émancipateur, pensé pour les humains et les humaines. Un tout nouveau Framadate, PeerTube en version 8, des améliorations pour Framaspace… nous vous avons préparé plein de surprises pour cette fin d'année ! Nous ne nous arrêterons pas en si beau chemin pour autant, pour 2026, nous souhaitons améliorer les services existants et en proposer de nouveaux ! Notre petite association existe grâce à la solidarité de nombreuses personnes. Vos dons1 permettent à plus de 2 millions de personnes d'accéder gratuitement à un numérique respectueux ! 1 Framasoft est reconnue d'intérêt général : chaque don est déductible à 66% pour les contribuables résidant en France.

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jobim2026.bsky.social
JOBIM 2026 @jobim2026.bsky.social · Nov 20
🎉 À VOS AGENDAS !
📅 Du 30 juin au 3 juillet 2026
📍 à Strasbourg, France

JOBIM 2026 revient pour sa 26ᵉ édition !

JOBIM est l’événement annuel qui réunit toute la communauté bioinformatique française, sous l’égide de la SFBI, en partenariat avec l’IFB et le GDR BIMMM.

vloux.bsky.social
Valentin Loux @vloux.bsky.social · Nov 12
Avec une com dans Nature des chercheurs ayant identifié les failles www.nature.com/articles/s41...

La question de la sécurité doit être au coeur des developpements, y compris en bioinformatique. Au dela du cas d'ONT, cela pose la question des formations ciblées "devs scientifique"et des moyens.

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camillemrcht.bsky.social
Camille Marchet ⚡ @camillemrcht.bsky.social · Nov 12
Bioinformatics x cybersecurity: Christina Boucher and her colleague Sara Rampazzi uncovered a basic yet critical vulnerability in MinIONs through the MinKNOW software bioengineer.org/portable-gen...
Portable Genetic Sequencer Security Vulnerabilities Could Endanger Personal
Portable genetic sequencers, particularly those manufactured by Oxford Nanopore Technologies, have revolutionized the field of genomics, making DNA sequencing more accessible and practical across the
bioengineer.org

vloux.bsky.social
Valentin Loux @vloux.bsky.social · Nov 8
"nos projections sur les impacts environnementaux à venir sont avant toutes coincées dans le présent"
" […]d’une IA qui se substitue à tous les usages numériques actuels, ne permettent pas d’imaginer ce que notre consommation d’énergie va devenir"

danslesalgorithmes.net/2025/06/16/i...
“Il est probable que l’empreinte environnementale de l’IA soit aujourd’hui la plus faible jamais atteinte”
Alors que l’IA s’intègre peu à peu partout dans nos vies, les ressources énergétiques nécessaires à cette révolution sont colossales. Les ...
danslesalgorithmes.net

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afp.com
Agence France-Presse @afp.com · Nov 7
⚫ Le prix Nobel américain James Watson, qui révolutionné la science en découvrant la structure de l'ADN avec son collègue Francis Crick, est décédé à l'âge de 97 ans, a annoncé vendredi le Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL), avec lequel il a travaillé ⬇️

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ifb-elixir-fr.bsky.social
IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · Nov 7
🚀👩‍💻🧑‍💻 End of this week of #BioHackEU25, organised by @elixir-europe.org , to advance all projects in synergy! Thank you to the IFB/ELIXIR-FR team (on-site and remotely), and to our colleagues at @genouest.bsky.social 👏

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inrae-migale.bsky.social
INRAE Migale @inrae-migale.bsky.social · Nov 4
@vloux.bsky.social présentait aujourd'hui l'entrepôt de données #Siduri devant le SAB et le COS du Grand Défi #Ferments_du_Futur 👏

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acupoftim.bsky.social
Tim @acupoftim.bsky.social · Nov 4
✏ Les Crayons Solidaires reviennent le mercredi 3 décembre à Paris, au Ground Control de 18h à 22h. Le principe est simple : vous venez sur place, vous payez pour qu'on vous tire le portrait, et tout l'argent va aux Restos du Coeur. Il y a aussi plein d'originaux et de tirages à acheter. À bientôt !
Les Crayons Solidaires, un événement au profit des Restos du Cœur. Mercredi 3 décembre de 18h à 22h. Ground Control, 81 Rue du Charolais, 75012 Paris. 20 Artistes présent.es : Boulet, Marielle Durand, Singeon, Sylvain Cnudde, Rémi Courgeon, Camille de Cussac, Alice Chemama, Karim Frihq, Hélène le Cam, Davy Mourier, Prims, Tim,Chloe Briggs, Pochep, Tristuss, Libon, Léah Touitou, Tido, Livio Fania, Matthias Bourdelier, Capucine, Maud Chalmel, halres Berbérian, Mat Let. Originaux et tirages d’artistes partenaires à retrouver en boutique : Pénélope Bagieu, Camille de Cussac, Boulet, kek, Singeon, Tido, Benoit Guillaume, Pierre Amoudry, Sylvain Cnudde, Rémi Courgeon, Marielle Durand, Marc Boutavant, Jacques de Loustal

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ifb-elixir-fr.bsky.social
IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · Nov 4
📢👩‍💻✍️ Inscription - Ecole thématique en bioinformatique intégrative (ETBII) du 29/03 au 3/04/2026, organisée par l’IFB !
🎯 Au programme : Combiner et analyser des données biologiques multi-omiques issues de différentes sources afin d’obtenir une compréhension globale des systèmes biologiques

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liberation.fr
Libération @liberation.fr · Oct 30
Plus de 900 sans-abri sont morts en 2024 : «Une augmentation exponentielle année après année»

Il s’agit majoritairement d’hommes (dans 82 % des cas), mais aussi, et de plus en plus, de femmes (13 %) et d’enfants.
Plus de 900 sans-abri sont morts en 2024 : «Une augmentation exponentielle année après année»
www.liberation.fr

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Valentin Loux @vloux.bsky.social · Oct 28
Les crises font se rendre compte de nos faiblesses et peuvent favoriser l'apparition de solutions. L'europe a un rôle certain (et urgent !) à jouer pour diminuer notre dépendance aux outils financés par les États-Unis.
cnrs.fr CNRS @cnrs.fr · Oct 28
Fragilisée par les incertitudes géopolitiques et le désengagement de certains partenaires, comme les États-Unis, la coopération scientifique internationale esquisse les contours d’une souveraineté scientifique nouvelle, à la fois ouverte et durable.
À l’heure d’une souveraineté scientifique partagée
Fondée sur des décennies de confiance et d’échanges, la coopération scientifique internationale se voit aujourd’hui fragilisée par les incertitudes géopolitiq
www.cnrs.fr

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bearstech.com
Bearstech @bearstech.com · Oct 28
La Python Software Foundation a retiré sa demande de financement de 1,5 million de dollars auprès de la NSF, bien que sa proposition ait été acceptée.

Cette décision a été motivée par une clause interdisant la promotion de la diversité, l’équité et l’inclusion.

👉 pyfound.blogspot.com...
“The PSF simply can’t agree to a statement that we won’t operate any programs that ‘advance or promote’ diversity, equity, and inclusion, as it would be a betrayal of our mission and our community.”