Valentin Loux | Lightnews

Light up
your news

Create account Sign in

About Privacy Terms Help

Valentin Loux

Valentin Loux

@vloux.bsky.social

220 followers 320 following 20 posts

Bioinformatics at @inrae-france.bsky.social

Biology 55%

Agriculture 15%

more

Posts Replies Media Videos

Valentin Loux @vloux.bsky.social · 3d

"nos projections sur les impacts environnementaux à venir sont avant toutes coincées dans le présent"
" […]d’une IA qui se substitue à tous les usages numériques actuels, ne permettent pas d’imaginer ce que notre consommation d’énergie va devenir"

danslesalgorithmes.net/2025/06/16/i...

“Il est probable que l’empreinte environnementale de l’IA soit aujourd’hui la plus faible jamais atteinte”

Alors que l’IA s’intègre peu à peu partout dans nos vies, les ressources énergétiques nécessaires à cette révolution sont colossales. Les ...

danslesalgorithmes.net

Reposted by Valentin Loux

Agence France-Presse @afp.com · 3d

⚫ Le prix Nobel américain James Watson, qui révolutionné la science en découvrant la structure de l'ADN avec son collègue Francis Crick, est décédé à l'âge de 97 ans, a annoncé vendredi le Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL), avec lequel il a travaillé ⬇️

Reposted by Valentin Loux

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 4d

🚀👩‍💻🧑‍💻 End of this week of #BioHackEU25, organised by @elixir-europe.org , to advance all projects in synergy! Thank you to the IFB/ELIXIR-FR team (on-site and remotely), and to our colleagues at @genouest.bsky.social 👏

Reposted by Valentin Loux

INRAE Migale @inrae-migale.bsky.social · 6d

@vloux.bsky.social présentait aujourd'hui l'entrepôt de données #Siduri devant le SAB et le COS du Grand Défi #Ferments_du_Futur 👏

Reposted by Valentin Loux

Tim @acupoftim.bsky.social · 7d

✏ Les Crayons Solidaires reviennent le mercredi 3 décembre à Paris, au Ground Control de 18h à 22h. Le principe est simple : vous venez sur place, vous payez pour qu'on vous tire le portrait, et tout l'argent va aux Restos du Coeur. Il y a aussi plein d'originaux et de tirages à acheter. À bientôt !

Les Crayons Solidaires, un événement au profit des Restos du Cœur. Mercredi 3 décembre de 18h à 22h. Ground Control, 81 Rue du Charolais, 75012 Paris.

20 Artistes présent.es : Boulet, Marielle Durand, Singeon, Sylvain Cnudde, Rémi Courgeon, Camille de Cussac, Alice Chemama, Karim Frihq, Hélène le Cam, Davy Mourier, Prims, Tim,Chloe Briggs, Pochep, Tristuss, Libon, Léah Touitou, Tido, Livio Fania, Matthias Bourdelier, Capucine, Maud Chalmel, halres Berbérian, Mat Let.

Originaux et tirages d’artistes partenaires à retrouver en boutique : Pénélope Bagieu, Camille de Cussac, Boulet, kek, Singeon, Tido, Benoit Guillaume, Pierre Amoudry, Sylvain Cnudde, Rémi Courgeon, Marielle Durand, Marc Boutavant, Jacques de Loustal

Reposted by Valentin Loux

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 7d

📢👩‍💻✍️ Inscription - Ecole thématique en bioinformatique intégrative (ETBII) du 29/03 au 3/04/2026, organisée par l’IFB !
🎯 Au programme : Combiner et analyser des données biologiques multi-omiques issues de différentes sources afin d’obtenir une compréhension globale des systèmes biologiques

Reposted by Valentin Loux

Libération @liberation.fr · 11d

Plus de 900 sans-abri sont morts en 2024 : «Une augmentation exponentielle année après année»

Il s’agit majoritairement d’hommes (dans 82 % des cas), mais aussi, et de plus en plus, de femmes (13 %) et d’enfants.

Plus de 900 sans-abri sont morts en 2024 : «Une augmentation exponentielle année après année»

www.liberation.fr

Valentin Loux @vloux.bsky.social · 14d

Les crises font se rendre compte de nos faiblesses et peuvent favoriser l'apparition de solutions. L'europe a un rôle certain (et urgent !) à jouer pour diminuer notre dépendance aux outils financés par les États-Unis.

CNRS @cnrs.fr · 14d

Fragilisée par les incertitudes géopolitiques et le désengagement de certains partenaires, comme les États-Unis, la coopération scientifique internationale esquisse les contours d’une souveraineté scientifique nouvelle, à la fois ouverte et durable.

À l’heure d’une souveraineté scientifique partagée

Fondée sur des décennies de confiance et d’échanges, la coopération scientifique internationale se voit aujourd’hui fragilisée par les incertitudes géopolitiq

Reposted by Valentin Loux

Bearstech @bearstech.com · 14d

La Python Software Foundation a retiré sa demande de financement de 1,5 million de dollars auprès de la NSF, bien que sa proposition ait été acceptée.

Cette décision a été motivée par une clause interdisant la promotion de la diversité, l’équité et l’inclusion.

👉 pyfound.blogspot.com...

“The PSF simply can’t agree to a statement that we won’t operate any programs that ‘advance or promote’ diversity, equity, and inclusion, as it would be a betrayal of our mission and our community.”

Reposted by Valentin Loux

CNRS @cnrs.fr · 14d

Fragilisée par les incertitudes géopolitiques et le désengagement de certains partenaires, comme les États-Unis, la coopération scientifique internationale esquisse les contours d’une souveraineté scientifique nouvelle, à la fois ouverte et durable.

À l’heure d’une souveraineté scientifique partagée

Fondée sur des décennies de confiance et d’échanges, la coopération scientifique internationale se voit aujourd’hui fragilisée par les incertitudes géopolitiq

Reposted by Valentin Loux

Richard Leggett @richardmleggett.bsky.social · 14d

Our MARTi @nanoporetech.com paper is now out in @genomeresearch.bsky.social after several years of development (particularly Ned Peel and Sam Martin). We'd love to hear from users about how you're using it, or suggestions for new features. @earlhaminst.bsky.social

genome.cshlp.org/content/earl...

Real-time analysis and visualization of nanopore metagenomic samples with MARTi

An international, peer-reviewed genome sciences journal featuring outstanding original research that offers novel insights into the biology of all organisms

genome.cshlp.org

Reposted by Valentin Loux

PlantEvolution 🌱🌾 @plantevolution.bsky.social · 14d

1/2 Want to become up to date with pangenomes and genome graphs and their history? Check out this fantastic review by @zbao.bsky.social!

Complexity welcome: Pangenome graphs for comprehensive population genomics
#pangenomes #plantscience #genomegraphs
www.cambridge.org/core/journal...

Reposted by Valentin Loux

PLOS Biology @plosbiology.org · 20d

Science projects are designed & funded on the scale of years, so what happens if you need to finish prematurely? @mhagenauer.bsky.social &co discuss solutions for quickly documenting partially finished projects & publishing ‘as you go’ in an uncertain environment @plosbiology.org 🧪 plos.io/4ovd1jH

The image shows a person with a suitcase, striding confidently through a doorway towards the sunset... and an uncertain future! Image credit Unsplash user Mantas Hesthaven.

Reposted by Valentin Loux

Galaxy Project @galaxyproject.bsky.social · 22d

Science, volcanoes, and the Galaxy community...what more could you ask for? 🌋🇫
In case you missed it! The Galaxy Community Conference (#GCC2026) lands in Clermont-Ferrand, France, June 22–24, 2026! CoFest follows from June 25–26.
Learn more and sign up for emails:
galaxyproject.org/events/gcc20...

2026 Galaxy Community Conference (GCC2026)

The annual gathering of the Galaxy Community with opportunities to hear latest developments, get training, and meet everyone involved.

galaxyproject.org

Reposted by Valentin Loux

Sophie Schbath @sophieschbath.bsky.social · 26d

Dans cet article qui vient de sortir dans NOV'AE, nous avons voulu répondre à la question "Le verre réutilisable au labo a-t-il un impact environnemental moindre que le plastique à usage unique ?", en utilisant une approche d'Analyse de Cycle de Vie. Avec M. de Paepe
revue-novae.fr/article/view...

Le verre réutilisable au laboratoire a-t-il un impact environnemental moindre que le plastique à usage unique ? Analyse avec l’outil EcoLabWare | NOV'AE - Ingénierie et savoir-faire innovant...

Reposted by Valentin Loux

Ryan Wick @rrwick.bsky.social · Sep 29

Happy to share that the paper describing Autocycler is now 100% up:
doi.org/10.1093/bioi...
(1/3)

Autocycler: long-read consensus assembly for bacterial genomes

AbstractMotivation. Long-read sequencing enables complete bacterial genome assemblies, but individual assemblers are imperfect and often produce sequence-l

Reposted by Simon Roux, Valentin Loux

Heng Li @lh3lh3.bsky.social · Sep 12

New blog post – A quick look at Roche's SBX
lh3.github.io/2025/09/11/a...

Reposted by Valentin Loux

Stephen Turner @stephenturner.us · Sep 10

New blog post: In Google's new paper, "An AI system to help scientists write expert-level empirical software" an AI supposedly "invents" new methods in bioinformatics and infectious disease modeling & forecasting. doi.org/10.59350/ymj... 🧬🖥️🧪

Reposted by Valentin Loux

Science Ouverte UPSaclay @so-upsaclay.bsky.social · Sep 10

✨ Résolument engagée dans la #scienceouverte, l' @univparissaclay.bsky.social lance, en 2026, ses presses universitaires en accès libre et gratuit.

📢L' #appel à candidature est ouvert pour son comité d'expertise scientifique.

🗓️ Date limite : 01/10/2025

En savoir plus : tinyurl.com/ms568zkn

Appel à candidature pour le Comité d'expertise scientifique des presses de l'Université

La diffusion des connaissances est au cœur des missions de notre université pour le développement de la recherche. Résolument engagée dans la science ouverte, l'Université Paris-Saclay a fait du libre...

www.universite-paris-saclay.fr

Reposted by Valentin Loux

France Génomique @fr-genomics.bsky.social · Sep 8

🚨PLEASE SHARE!
France Génomique and the National network GREEN-omics are pleased to inform you of their upcoming Symposium on Environmental and Agronomical Genomics!
📍Paris, France, Feb 18 to 20, 2026.
➡️ eags2026.sciencesconf.org
➡️ Registration and call for abstracts are now open!

Reposted by Valentin Loux

Rayan Chikhi @rayanchikhi.bsky.social · Sep 3

One year after our initial preprint, we're excited to post a major update to Logan.

At its heart, Logan is the assembly of 27 million samples (50 Pbp) using a 6-day cloud-compute peaking at 2.2M vCPUs. This compresses the SRA 140x compared to raw FASTQs.

github.com/IndexThePlan...

Valentin Loux @vloux.bsky.social · Aug 22

magnifique ! Ça donne envie

Valentin Loux @vloux.bsky.social · Aug 9

c’est pas mal. bien équilibré. je vais essayer d’en rapporter une bouteille

Valentin Loux @vloux.bsky.social · Aug 9

Dégustation de boissons fermentées en Pologne. Classique Komboucha et plus local buza (boulgour, raisin). Les deux produits localement. #fermentsdufutur

Valentin Loux @vloux.bsky.social · Aug 3

Bravo à @auschwitzmemorial.bsky.social de faire vivre ce lieu de mémoire, si iomportant à visiter pour lutter contre la répétition des horreurs de l’histoire.

Valentin Loux @vloux.bsky.social · Aug 3

Visite du mémorial d’Auschwitz-Birkenau. Un moment d’émotions et de recueillement mémoriel vécu en famille, accompagné par une guide d’une exceptionnelle justesse.

Reposted by Valentin Loux

Auschwitz Memorial @auschwitzmemorial.bsky.social · Aug 3

3 August 1911 | A Frenchman, Jean Berthout, was born in Limoges.

In #Auschwitz from 8 July 1942.
No. 45230
He perished in the camp on 13 August 1942.

Reposted by Philippe Meirieu, Valentin Loux, Constance Bantman , and 1 more Philippe Meirieu, Valentin Loux, Constance Bantman, Bernard Davasse

Libération @liberation.fr · Jul 17

Reportage dans le massif du Mont-Blanc : ceci était la Mer de Glace

C'est la une de Libération ce vendredi

Reposted by Valentin Loux

Institut Pasteur | 130 years of biomedical research @pasteur.fr · Jul 24

Congratulations to Rayan Chiki, (Institut Pasteur) head of the “Sequence Bioinformatics” unit, for securing the ERC Proof of Concept 2025 for his project ENZYMINER! 👏

‪@rayan.chiki.bsky.social

#Bioinformatics

Reposted by Valentin Loux

Sophie Schbath @sophieschbath.bsky.social · Jul 22

www.lemonde.fr/economie/art...

Mistral AI parie sur la transparence en rendant public son impact environnemental

La start-up française d’intelligence artificielle publie avec l’Ademe et Carbone 4 une étude sur l’impact, notamment sur les émissions de CO₂, de l’entraînement et l’usage de ses modèles. Et appelle s...