Felix Hartkopf
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Felix Hartkopf
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bioinformatician at the Robert Koch Institute (RKI); specialized in integrated genomic surveillance and genomic epidemiology, working in MF1 - Genome Competence Center to support public health research.
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torstenseemann.bsky.social
💾 Shovill 1.4.1 has been released!
The best way to de novo assemble microbial genomes from Illumina FASTQ.
Major fixes to the SKESA module, plasmid mode for the Spades module, and more error checking.
#bioinformatiocs #genomics #microbiology
github.com/tseemann/sho...
Releases · tseemann/shovill
⚡♠️ Assemble bacterial isolate genomes from Illumina paired-end reads - tseemann/shovill
github.com
December 13, 2025 at 9:15 PM
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ebi.embl.org
From a farm in the north of England to the frontiers of bioinformatics, our Group Leader Sandra Orchard reflects on a career building the data foundations of modern biology:

“AI is showing how vital data curation really is.”

www.ebi.ac.uk/about/news/p...

🖥️🧬
Sandra Orchard: what I’ve learned
EMBL-EBI Team Leader Sandra Orchard reflects on a life in protein science, UniProt data curation, and championing open data standards.
www.ebi.ac.uk
November 25, 2025 at 3:15 PM
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rki.de
Zur Überwachung der Tuberkulosesituation und Bewertung erzielter Fortschritte braucht man eine gute Kenntnis der epidemiologischen Lage.

📉 Der Bericht zur „Epidemiologie der #Tuberkulose in Deutschland 2024“ liefert dazu wichtige Erkenntnisse.

Alle Zahlen und Fakten:
🔗 www.rki.de/tuberkulose
Mikroskopaufnahme von Tuberkulosebakterien (Mycobacterium tuberculosis) in bläulicher und gelblicher Färbung. Darüber liegt der Text: „Epidemiologischer Bericht für 2024 – Leichter Rückgang der Tuberkulose-Fälle in Deutschland“ Grafik mit blauem Hintergrund und Text zur aktuellen Tuberkulose-Lage in Deutschland 2024. Erwähnt werden 4.391 Erkrankungen, ein Rückgang antibiotikaresistenter Tuberkulose um 23 % sowie der Einfluss von Krieg und Krisen. Unten rechts eine Illustration einer Lupe mit gezeichneten Bakterien. Grafik mit blauem Hintergrund und Text zur Früherkennung und Meldung von Tuberkulose. Hervorgehoben wird die Bedeutung der Untersuchung von Kontaktpersonen und Kindern. Rechts unten Illustration einer Ärztin, die ein Kind bei einer sitzenden Frau untersucht. Grafik mit blauem Hintergrund und Text zu weiterführenden Informationen über Tuberkulose auf der Website rki.de/tuberkulose sowie im Ratgeber Tuberkulose und beim BIÖG. Oben Symbol einer Weltkugel mit Mauszeiger, unten Icons für „Liken“, „Teilen“, „Reposten“ und „Speichern“. Text: „Etwas gelernt?“.
October 27, 2025 at 12:13 PM