Para más, checa los anuncios de @lieberinstitute.bsky.social

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además del comunicado de prensa de la Asociación Americana de Psiquiatría

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¡Y gracias a @lahuuki.bsky.social por el hilo 🧵 original!

Gracias a @nataliematosin.bsky.social y Sophie Debs por resaltar nuestro trabajo en su editorial “Desbloqueando los Secretos Moleculares de la Habénula Humana”

🔗 doi.org/10.1176/appi...

Estos datos servirán para trabajo futuro sobre cambios moleculares que ocurren en #Habénula en enfermedades 🧠🧬 Mantén un 👀 abierto en @lieberinstitute.bsky.social para nuevos resultados de Hb de datos transcriptómicos con resolución espacial @10xgenomics.bsky.social

speakerdeck.com/lahuuki/2025...

Nuestros datos de #Habénula y de expresión diferencial pueden ser explorados vía sitios web interactivos 💻 #DatosLibres #iSEE 👀

github.com/LieberInstit...

Usamos análisis de #eQTL para examinar como los SNPs se relacionan a la expresión génica en #Habénula. 7 genes eQTLs fueron identificados como GDEs, y 16 eSNPs como SNPs de riesgo a la esquizofrenia en GWAS. 9 nuevos genes fueron colocalizados con el riesgo genético de esquizofrenia

Investigamos si los GDEs que encontramos eran únicos a la #Habénula vs otras regiones del cerebro con estudios de esquizofrenia (núcleo caudado, giro dentado, dlPFC, hipocampo) y encontramos que 75% de los GDEs eran únicos a la habénula 🦄

Este análisis identificó 173 genes diferencialmente expresión (GDEs; DEGs en inglés) entre donadores control y los afectados por esquizofrenia. Algunos de estos GDEs (como HES5) apoyan la hipótesis del neurodesarrollo de la esquizofrenia 🌋

Para refinar la señal de habénula del vecino tálamo utilizamos nuestros datos de #snRNAseq para #deconvolución de nuestras muestras a granel #bulkRNA, estimando así la proporción de Hb. Estas proporciones las usamos para controlar diferencias en disecciones en el análisis de expresión diferencial 📊

También analizamos tejido enriquecido en Hb de donadores control o con esquizofrenia usando secuenciación masiva de ARN, generando un set de datos único para identificar cambios moleculares asociados a la enfermedad. ACP (PCA🇺🇸) de datos #bulkRNA de otras regiones muestran que la Hb es un caso aparte

Para contextualizar, integramos nuestros datos de #snRNAseq de Hb humana con datos #singlecell previamente publicados de Hb de ratón por el laboratorio de @gstuber.bsky.social. Algunos grupos de células neuronales como las LHb.2 enriquecidas por OPRM1 en humano aparecen conservadas entre especies 🐁

Usamos hibridación fluorescente in situ de molécula única #RNAScope y HALO de @indicalabs.bsky.social para visualizar la organización espacial de estas poblaciones neuronales de la Habénula humana. 🔬 Por ejemplo, neuronas MHb.2 que expresan CHAT se agruparon de forma separada de otras células de MHb

Creamos un mapa molecular con #snRNAseq de la Hb humana para entender la diversidad neuronal a un nivel molecular en esta región del cerebro única. Nuestros datos de 7 donadores control produjeron 16 mil núcleos y 17 grupos celulares, incluyendo 7 poblaciones neuronales laterales y 3 medias en Hb 🧪

¡Gracias a nuestros colaboradores del Instituto Lieber para el Desarrollo del Cerebro por su dedicación y arduo trabajo en este proyecto! 🧑‍🔬 #HabenulaLIBD @freneegf.bsky.social @nick-eagles.bsky.social @lahuuki.bsky.social @kr-maynard.bsky.social de la división lidereada por @martinowk.bsky.social

Finally, we made 2 web tools to share to this unprecedently large human LC xscriptomic data. A 3rd (that visualizes high-res H&E and NM with and spatial gene xpr.) on the way (last URL). We hope these help the #bluespot #LC #catecholamines community! Tools at: research.libd.org/LFF_spatial_... (7/8)