Sylvain Prigent
sylvainprigent.bsky.social
Sylvain Prigent
@sylvainprigent.bsky.social
Bioinformatics, metabolomics and Plant science
Ce fut un tel plaisir de participer à l'organisation de ces JOBIM !
Encore merci à toute l'équipe d'organisation !
👏 Ca y est, #JOBIM2025 est officiellement fini !

Au nom de toute l'équipe, merci pour votre participation, et pour toutes ces discussions scientifiques intenses et stimulantes.
Merci aussi pour votre enthousiasme, votre bienveillance et tous ces rires échangés pendant la conférence.

1/2 ⤵️
July 11, 2025 at 7:42 PM
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This morning, Cathleen presented results at the GPR-BPS general assembly, based on data acquired on our metabolomics platform. Great to see our work contributing to broader research efforts! #Metabolomics
June 13, 2025 at 9:35 AM
Reposted by Sylvain Prigent
🌱 Le comité d'organisation de #JOBIM2025 remercie chaleureusement le GPR BPS pour son soutien au congrès qui se tiendra les 8-11 juillet à Bordeaux.

Vous ne connaissez pas le GPR BPS ? 🤔

1/2 ⤵️
LinkedIn
This link will take you to a page that’s not on LinkedIn
lnkd.in
May 23, 2025 at 8:19 AM
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‼️ Rappel ‼️

📍 La SFBI propose 15 bourses de voyage pour @jobim2025.bsky.social !

ℹ️ Plus d'informations : www.sfbi.fr/blog/article...

📎 Dossier accessible en ligne : www.sfbi.fr/static/doc/S...

⏳ Soumission des dossiers du 15 mai au 5 juin 2025

✉️ Pour toutes questions : contact@sfbi.fr 🙂
📍 La #SFBI propose deux types de #bourses pour les @jobim2025.bsky.social (jobim2025.labri.fr) qui auront lieu du 8 au 11 juillet 2025 à Bordeaux.

✉️ Pour toutes demandes d'informations, n'hésitez pas à prendre contact avec nous via contact@sfbi.fr ‼️
May 27, 2025 at 10:33 AM
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Quelques 📸 des Journées Jeunes Chercheur·e·s du département BAP, à Bordeaux 14-16 mai
Organisées par un comité local, elles ont permis de mettre en valeur les travaux scientifiques des doctorant·e·s et postdoc via des présentations orales, posters, échanges scientifiques et moments de convivialité 👏
May 21, 2025 at 10:55 AM
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plants.peercommunityin.org, new Peer Community In .. PLANTS !
April 27, 2025 at 9:05 AM
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Coup de projecteur sur des projets en rupture et à haut risque du programme EXPLOR’AE
✔️39 idées exploration et 5 projets transformation déjà financés #France2030
Des hypothèses originales pour des innovations de rupture, des recherches qui sortent des sentiers battus !
url.inrae.fr/44ySyng
EXPLOR’AE : INRAE dévoile des projets de recherche en rupture et à haut risque
DOSSIER DE PRESSE - Le programme France 2030 « Accélération de la recherche à risque en Agriculture, Alimentation et Environnement » EXPLOR’AE offre un cadre inédit pour soutenir des projets de recher...
url.inrae.fr
April 16, 2025 at 9:08 AM
Reposted by Sylvain Prigent
Interesting critique in Nature Metabolism on misusing gene-centric tools for #metabolomics data 🧪.
Turns out metabolites ≠ genes🧬—and forcing them into gene-style pathway analysis can really skew results! Worth a read if you're into #systems-biology or #bioinformatics.
🔗 doi.org/10.1038/s422...
Metabolites are not genes — avoiding the misuse of pathway analysis in metabolomics - Nature Metabolism
Pathway analysis, originally developed for gene expression data, has been adapted for metabolomics. However, owing to the unique characteristics and constraints of metabolites compared with genes, pat...
doi.org
April 18, 2025 at 7:41 AM
We're hiring!
We're looking for a postdoc in systems biology with a focus on metabolic modeling
Great science, great people and a great place to work (yes, I’m biased)
The position will be co-supervised by the brilliant @cfrioux.bsky.social
Details&application: recrutement.inria.fr/public/class...
April 8, 2025 at 7:17 AM
Reposted by Sylvain Prigent
Dans moins d'une semaine, l'appel à soumissions pour #JOBIM2025 sera fini ‼️

🕛 Pour rappel, vous avez jusqu'au lundi 31 mars, à 23h59 (CET), pour nous partager vos travaux.

Alors bon courage à tou.te.s pour cette dernière ligne droite !
❗❗BREAKING NEWS❗❗

Les soumissions pour #JOBIM2025 sont ouvertes ! 😱
💡Articles longs, posters, démos, etc ; de nombreux formats sont attendus.

Les consignes détailles seront accessibles sur le site de #JOBIM2025 ➡️ jobim2025.labri.fr

⏳ Les soumissions fermeront le 31 mars, alors faîtes vite !
Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques - 2025
jobim2025.labri.fr
March 26, 2025 at 9:29 AM
Reposted by Sylvain Prigent
Aujourd'hui Coralie de #meta présentait son sujet de doctorat dans MT180
Trois minutes de présentation pour nous apprendre comment Batman et elle-même peuvent utiliser les réseaux métaboliques pour sauver le monde !
March 27, 2025 at 3:19 PM
N'oubliez pas, la finale de #mt180 à Bordeaux c'est aujourd'hui !
Venez notamment entendre parler de réseaux métaboliques et de métabolomique !
#Agenda 📅 La finale du concours @univbordeaux.bsky.social @mt180fr.bsky.social , c'est demain à partir de 13h30 : 18 candidats, qui auront 3 minutes pour se qualifier pour la finale régionale qui aura lieu le 10/04 à @univ-larochelle.fr ! Retransmission en direct sur YouTube
www.u-bordeaux.fr/ev...
March 27, 2025 at 7:14 AM
Reposted by Sylvain Prigent
✨ PLUS QUE DEUX MOIS avant #pint25

📍 +55 villes, du Parc naturel du Limousin à la Réunion et la Guyane
🔬 Des centaines de scientifiques passionné·e·s
🫂 500 organisateurs·trices à fond !

📱 Programme : 31 mars
🎟 Tickets : 14 avril
👉 pintofscience.fr
March 19, 2025 at 8:10 AM
Reposted by Sylvain Prigent
Juste un petit rappel au cas où ... mais la deadline des #soumissions pour #JOBIM2025 c'est dans quelques jours ... ⏲️ Ce serait dommage de la louper 😃 On a hâte de voir les travaux de la communauté 🤓
🥁 Les #soumissions pour #JOBIM2025 sont officiellement ouvertes !! Vous avez jusqu'au 31 mars pour soumettre vos travaux. On a hâte !! 🤓
❗❗BREAKING NEWS❗❗

Les soumissions pour #JOBIM2025 sont ouvertes ! 😱
💡Articles longs, posters, démos, etc ; de nombreux formats sont attendus.

Les consignes détailles seront accessibles sur le site de #JOBIM2025 ➡️ jobim2025.labri.fr

⏳ Les soumissions fermeront le 31 mars, alors faîtes vite !
March 4, 2025 at 5:02 PM
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Exclusive: NSF this week began to search through billions of dollars of grants the agency has already awarded for anything touching on topics that President Donald Trump has criticized. And NSF has blocked grantees and trainees from accessing funds while the review is underway. scim.ag/3El0NZh
EXCLUSIVE: NSF starts vetting all grants to comply with Trump’s orders
Grantee accounts remain frozen, while union accuses NSF of ignoring rules governing peer review
scim.ag
January 30, 2025 at 11:26 PM
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➡️ M Björn GRÜNING sera #keynote speaker à #JOBIM2025

Il nous vient d'Allemagne, du département d'Informatique de l'Université de Freiburg.

💡 Si les workflows, la reproductiblité et la science ouverte vous intéressent, venez l'écouter et le rencontrer en Juillet à Bordeaux, pour #JOBIM2025 !
January 21, 2025 at 9:04 AM
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➡️ Mme Emma Schymanski sera #keynote speaker à #JOBIM2025

Emma nous vient du Centre pour la Biomédecine Systémique de l'Université du Luxembourg.

📊 Si les statistiques, le traitement ou l'intégration de données métabolomiques vous intéressent, rendez-vous en Juillet à Bordeaux, pour #JOBIM2025 !
January 22, 2025 at 8:55 AM
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➡️ M Eric Rivals sera #keynote speaker à #JOBIM2025 !

Eric mène sa recherche au Laboratoire d'Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier.

🧬 Si le développement de méthodes et d'algorithmes pour les séquences vous intéresse, rendez-vous en Juillet à Bordeaux pour #JOBIM2025 !
January 23, 2025 at 8:48 AM
Reposted by Sylvain Prigent
➡️ M Jean Monlong sera #keynote speaker à #JOBIM2025 !

Il travaille à l'Institut de Recherche en Santé Digestive de Toulouse.

💊 Si la génomique fonctionnelle et intégrative vous intéresse, ne manquez pas de l'écouter et de le rencontrer en Juillet à Bordeaux pour #JOBIM2025 !
January 27, 2025 at 8:14 AM
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➡️ Mme Anamaria NECSULEA sera #keynote speaker à #JOBIM2025 !

Anamaria travaille au Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive de Lyon.

🐒 Si la génomique évolutive et la phylogénie vous intéressent, ne manquez pas de l'écouter et de la rencontrer en Juillet à Bordeaux, pour #JOBIM2025 !
January 28, 2025 at 9:41 AM
Reposted by Sylvain Prigent
Meet Maggot: a web-based tool for managing and sharing research metadata! It simplifies dataset organization, FAIR compliance, and collaborative metadata creation, enabling efficient sharing and documentation. #FAIRdata #OpenScience
doi.org/10.1093/giga...
An ecosystem for producing and sharing metadata within the web of FAIR Data
AbstractBackground. Descriptive metadata are vital for reporting, discovering, leveraging, and mobilizing research datasets. However, resolving metadata is
doi.org
January 14, 2025 at 9:22 AM
Reposted by Sylvain Prigent
L'appel à proposition pour les mini #symposiums de #JOBIM2025 est lancé !!

Un mini-symposium:
➡️ réunit des scientifiques autour d'une thématique spécialisée en #bioinformatique 🗣️
➡️ dure 3 heures ⌚

⌛Attention, vous avez jusqu'au Vendredi 17 Janvier 2025 à 18h pour nous envoyer vos propositions!
📢 Appel à propositions pour les mini #symposiums pour @jobim2025.bsky.social
➡️ deadline : 17/01/2025 18h
➡️ objectif : réunir des scientifiques autour de thématiques spécialisées en #bioinformatique
➡️ durée : 3 heures
➡️ autofinancement (enveloppe de soutien possible via la #SFBI)
November 29, 2024 at 1:48 PM
Reposted by Sylvain Prigent
Bordeaux Metabolome was well-represented at the 13th Metabohub Scientific Days! Theoretical insights and practical sessions were engaging and insightful. It was wonderful to meet in person after so many virtual meetings!
October 18, 2024 at 12:42 PM
Reposted by Sylvain Prigent
🍂 Septembre touche déjà à sa fin... 🍃
Contrairement à nos efforts pour préparer un super JOBIM 2025 ! 🎉
Alors vous aussi, préparez-vous pour l'évènement annuel de la bioinformatique française, et marquez dès maintenant dans vos agendas qu'il aura lieu à Bordeaux du 8 au 11 juillet 2025 !
September 30, 2024 at 2:53 PM
Reposted by Sylvain Prigent
📢 Le 15 novembre de 13h30 à 16h30 MetaboHUB vous présentera les grandes orientations scientifiques de l'infrastructure pour la période 2025-2027, avec des développements pour une métabolomique plus robuste, plus sensible et intégrant les nouvelles avancées de l’IA
Lien d'inscription gratuite à venir
September 16, 2024 at 2:47 PM