Frédéric RIMET
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Frédéric RIMET
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Happy to share our new paper in ISME communications:
Can genetic diversity in microalgae species be explained by climate: an overview of metabarcoding with diatoms
Kulaš, Lemmonnier, Alric, Kahlert, Trobajo, Udovič & Rimet […]

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October 21, 2025 at 10:41 AM
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La grande odyssée de @batolabo a bien démarré, avec des échantillonnages d'ADNe sur plusieurs 100aines de kilometres !!

@batolabo great odyssey got off to a good start, with #edna samplings over several hundred kilometers!

Loire -> Danube odyssey
October 15, 2025 at 7:31 AM
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really happy to have this paper with all my good colleagues :-)
October 14, 2025 at 12:06 PM
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📚 Explore the #eDNAquaPlan Zenodo Community!
Find our open-access records, reports & deliverables on shaping a FAIR & harmonised digital ecosystem for aquatic #eDNA data.

👉 zenodo.org/communities/...

#OpenScience #Biodiversity #FAIRdata #eDNA
October 9, 2025 at 7:27 AM
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Happy to share a new paper:
Phototrophic periphyton tolerance reflects in situ exposure to pharmaceuticals overtime – A translocation study using a pollution-induced community approach (PICT)
In Journal of Hazardous Materials […]

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August 29, 2025 at 8:46 PM
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A new paper by Laurine Viollaz, a engineer working with me in the framework of #metabarcoding #phytoplankton #lake #france

Viollaz, L., Rimet, F., & Alric, B. (2025). Environmental DNA Approach for Lake Phytoplankton Monitoring. ACS ES&T Water. https://doi.org/10.1021/acsestwater.5c00669
The European Water Framework Directive (WFD) requires monitoring to achieve or maintain good ecological status of lakes, which support major socio-economic services. Traditionally, a morphology-based identification of individuals is used for the biomonitoring. Environmental DNA (eDNA) has significantly enhanced the evaluation of biodiversity in aquatic ecosystems. In addition, the eDNA metabarcoding approach without taxonomic-assignment (the so-called taxonomy-free approach) seems to be more promising for biomonitoring than the taxonomy-based approach. For the moment, there is a lack of empirical evidence showing the relevance of the taxonomy-free approach for assessing the ecological status of lakes based on phytoplankton, a key biological group used under the WFD. In this study, we coupled an eDNA metabarcoding approach with a niche model and an unsupervised machine learning method to assess the ecological status of 239 samples collected in 98 lakes across France. In practice, we have developed a biotic index using the abundance profiles of Amplicon Sequence Variants (ASVs) along a specific environmental gradient to assess the latter. We showed that this index, based on the taxonomy-free approach, had a strong ability to predict the ecological status of samples along an anthropogenic gradient, representing eutrophication levels.
October 6, 2025 at 1:16 PM
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Aquatic #eDNA presents gaps in data standards & connectivity.

A FAIR, federated digital ecosystem with interoperable metadata is key to unlocking its full potential across Europe. 🌍🧬

🧾 Read the proposal draft by the #eDNAquaPlan team: tinyurl.com/3mdnjzxd

#Science

@boulangerem.bsky.social
July 24, 2025 at 8:37 AM
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We have a post-doc position for 15 months in the framework of the https://dnaquaimg.eu/ project (11 countries) at UMR Carrtel https://carrtel.lyon-grenoble.hub.inrae.fr/unit (Lake Geneva, France).
If you have good skills in molecular biology, aquatic ecology […]

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July 18, 2025 at 7:02 AM
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A new paper with my good friend/colleague Kalman

Tapolczai, K., F. Rimet, M. Ćirić, A. Ballot, C. Laplace-Treyture, & B. Alric, 2025. A novel framework for phytoplankton biomonitoring: Trait assignment of 23S rRNA sequences. Ecological Indicators 173: 113361 […]

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July 18, 2025 at 6:38 AM
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Happy to announce a new paper of my phD student Paula Gavin
Gauvin, P., I. Domaizon, A. Bouchez, & F. Rimet, 2025. Environmental Matrices Need Consideration: Insights From Water and Biofilm Environmental DNA for Multi-Taxonomic Biomonitoring. Environmental […]

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July 18, 2025 at 6:32 AM
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Please find our new paper in Molecular Ecology:
Omics to Study and Manage Aquatic Environments: A Snapshot From the AquaEcOmics Meeting (Evian-les-Bains, 2025). https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/mec.70041

A good summary of the […]

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Sankey diagram giving the proportions of contributions (oral and poster communications) given at the AquaEcOmics meeting in Evian from March 2025, depending on the study scope and the input category. The above diagram is given for microorganisms (74 contributions) and the diagram below for macroorganisms (64 contributions). Themes contributions given at the AquaEcOmics meeting in Evian from March 2025. The three major themes gather topics in coloured circles and are synthetised in Section 3 (Fundamental science discoveries in aquatic ecology and biology), Section 4 (Stakeholder-driven research) and Section 5 (Methodological gaps and possible solutions).
July 23, 2025 at 1:38 PM
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hospimedia.bsky.social
Pour la journée mondiale de la #Trisomie21, le vice-président de @unapei.bsky.social Christian Biotteau alerte sur le vieillissement des personnes concernées.

🔗 tinyurl.com/mp46hw7d
✍️ Propos recueillis par @allieredoxie.bsky.social
March 21, 2025 at 8:53 AM
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🟢"L’éthique n’est pas une théorie, c’est une boussole !"

Le réseau Unapei s’est réuni hier pour échanger sur les réflexions éthiques qui doivent guider et transformer nos organisations et nos pratiques d’accompagnement.
Luc Gateau, président de l’Unapei, prend la parole derrière un pupitre lors du séminaire "Autodétermination : enjeux éthiques de l’accompagnement", organisé le 25 mars 2025. En arrière-plan, une projection affiche le titre de l’événement ainsi que les logos des partenaires Crédit Coopératif et Groupe Apicil.
March 26, 2025 at 10:39 AM
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🟢📢L’Unapei regrette que le budget de certains départements ne puissent subvenir aux besoins réels et aux droits des personnes en situation de handicap.

Le président de l’Unapei Luc Gateau a rencontré l’association des départements de France, aux côtés d’autres acteurs associatifs. (1/2) 👇
Réunion formelle autour d'une grande table en U, dans une salle de conférence lumineuse avec de nombreuses lampes encastrées au plafond. Plusieurs personnes sont assises de part et d’autre de la table, en train de discuter ou de prendre des notes. Sont présents Luc Gateau, président de l’Unapei, Marc Fleuret, représentant de l’Association des départements de France. D'autres personnes sont des représentants du Collectif Handicaps. Un écran en fond de salle montre une participante intervenant à distance en visioconférence. Des micros, bouteilles d’eau et gobelets en carton sont disposés sur la table. L’ambiance est studieuse et institutionnelle.
March 26, 2025 at 4:58 PM
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🟢📢«Tout ce qui relève du déficit intellectuel reste peu considéré par les politiques publiques.»

Le Président de l’Unapei Luc Gateau revient sur le CIH et souligne le manque de prise en compte des besoins spécifiques de 700 000 personnes concernées👇

directions.fr/Piloter/orga...
CIH : L’accessibilité en panne - Piloter - Directions.fr
Parmi les motifs de déception des acteurs associatifs à l’issue du conseil interministériel du handicap début mars ? Le manque d’avancées en matière d’accessibilité.
directions.fr
March 27, 2025 at 4:30 PM
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🟢📢 Le handicap, 1er motif de discrimination en France pour la 8ème année consécutive.

Education, accessibilité, emploi... le Défenseur des Droits alerte sur tous les aspects de la vie.

Le lien vers son dernier rapport 👇
t.co/1CLuBcHjfy
https://informations.handicap.fr/a-le-handicap-1er-motif-de-discriminations-depuis-8-ans-37885.php
t.co
April 1, 2025 at 3:28 PM
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🟢📢 Autisme : qui prendra le relais quand les familles ne seront plus là ?

Faute d'accompagnements adaptés aux besoins de l'autisme, des milliers de parents doivent se mobiliser jour et nuit pour soutenir leurs enfants.

L'Unapei appelle à agir 👇
www.latribune.fr/idees/tribun...
OPINION. « Autisme : qui prendra le relais quand les familles ne seront plus là ? »
OPINION. À l’occasion de la Journée mondiale de la sensibilisation à l’autisme, Luc Gateau, président de l’Unapei, alerte : dans un système à bout de souffle, les familles sont, aujourd’hui, un soutie...
www.latribune.fr
April 2, 2025 at 8:37 AM
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🟢🖊️Rendre le train accessible à tous !

Le Président Luc Gateau était présent hier à la maison de l’#autisme pour la signature de la charte pour l’inclusion des voyageurs autistes dans le milieu ferroviaire, co-construite avec l’Unapei. (1/2) 👇
April 3, 2025 at 3:59 PM
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🏅Le Président de l’Unapei décoré de la légion d’honneur !

🟢Le 11 avril, Luc Gateau a reçu la Légion d’honneur au grade de chevalier.

✊Père d’une fille en situation de handicap, il œuvre depuis des années pour faire entendre la voix des PSH intellectuel et de leurs familles.
Luc Gateau, président de l’Unapei, en costume bleu marine et décoré de la Légion d’honneur, prend la parole devant un public. Il tient un micro et sourit, une médaille accrochée à la veste. À l’arrière-plan, un panneau Unapei et une fresque illustrée. La scène a lieu lors de la remise de sa décoration, le 11 avril.
April 15, 2025 at 7:13 AM
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Autodétermination, accompagnement éthique pour les personnes porteuses de handicap : Excellent article reprenant les actions phares du mouvement Unapei
Ethique et accompagnement : agir pour et avec les personnes concernées […]

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April 22, 2025 at 7:32 PM
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Une chouette photo de famille pour l'ag Unapei Auvergne Rhone Alpes #unapei #unapeiauvergne_rhone_alpes #APEI #apei_thonon #hautesavoie #disability #handicap #autonomie #autodétermination #inclusion
April 23, 2025 at 3:30 PM
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mbmg.pensoft.net
Congratulations to Teun Everts (@teuneverts.bsky.social) and Thomas Reinhart for winning the Best Student Presentation awards at the #AquaEcOmics meeting in Evian, France!

mbmg.pensoft.net/news/806

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Metabarcoding and Metagenomics recognises student talent at the AquaEcOmics meeting in Evian
The 2025 AquaEcOmics meeting was held in Evian, France from 17 to 20 March 2025.Described as "a meeting to explore aquatic ecosystems biodiversity, functioning and monitoring with eDNA and multi-...
mbmg.pensoft.net
March 28, 2025 at 7:28 AM
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Poster session #aquaecomics meeting!!
March 20, 2025 at 8:33 PM
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Big thank to the chairmans/women #aquaecomics meeting!!
March 20, 2025 at 8:31 PM
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Big thank to the chairmans/women #aquaecomics meeting!!
March 20, 2025 at 8:30 PM