e-COL+
@e-colplus.bsky.social
Projet Equipex+ (ANR-21-ESRE-0053)
🎯Objectif : Numériser en 3D les collections naturalistes françaises
🤝Partenaires : #CNRS, CINES, CNAM, EPHE, UCBL, UBE, @sorbonne-universite.fr, @ird-fr.bsky.social, @umontpellier.bsky.social, @mnhn.fr
www.ecolplus.fr
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· Sep 3
e-COL+ Numérisation 3D des collections naturalistes.
Projet e-COL+ Numérisation 3D des collections naturalistes a bénéficié d'une aide de l’État PIA3-ANR-21-ESRE-0053
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Discover:
- the #digitization of French natural history #collections
- the equipment available
- our partner institutions
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Aide à la #numérisation3D pour #e-COL+
L’équipe Consult.O. (T. Oudoire, H. Bordet) a numérisé plus de 100 types d’ammonites des #collections de l’UCBL (tinyurl.com/ystcv6s2), avec le soutien du labo Biogéosciences (UBE CNRS EPHE), merci Emmanuel Fara !
🙏 Merci Nicolas Rinder pour la formation !
L’équipe Consult.O. (T. Oudoire, H. Bordet) a numérisé plus de 100 types d’ammonites des #collections de l’UCBL (tinyurl.com/ystcv6s2), avec le soutien du labo Biogéosciences (UBE CNRS EPHE), merci Emmanuel Fara !
🙏 Merci Nicolas Rinder pour la formation !
November 6, 2025 at 12:58 PM
Aide à la #numérisation3D pour #e-COL+
L’équipe Consult.O. (T. Oudoire, H. Bordet) a numérisé plus de 100 types d’ammonites des #collections de l’UCBL (tinyurl.com/ystcv6s2), avec le soutien du labo Biogéosciences (UBE CNRS EPHE), merci Emmanuel Fara !
🙏 Merci Nicolas Rinder pour la formation !
L’équipe Consult.O. (T. Oudoire, H. Bordet) a numérisé plus de 100 types d’ammonites des #collections de l’UCBL (tinyurl.com/ystcv6s2), avec le soutien du labo Biogéosciences (UBE CNRS EPHE), merci Emmanuel Fara !
🙏 Merci Nicolas Rinder pour la formation !
Fiers de voir #eCOL+ cité par @lsu.bsky.social Museum of Natural Science pour son aide sur des poissons du @mnhn.fr 🐟
Dan Sinopoli a analysé 55 spécimens de poisson-castors et orphies. L'un des spécimens scannés par #eCOL+ présentait les restes de son dernier repas!
👉 www.lsu.edu/mns/files/ne...
Dan Sinopoli a analysé 55 spécimens de poisson-castors et orphies. L'un des spécimens scannés par #eCOL+ présentait les restes de son dernier repas!
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October 26, 2025 at 2:52 PM
Fiers de voir #eCOL+ cité par @lsu.bsky.social Museum of Natural Science pour son aide sur des poissons du @mnhn.fr 🐟
Dan Sinopoli a analysé 55 spécimens de poisson-castors et orphies. L'un des spécimens scannés par #eCOL+ présentait les restes de son dernier repas!
👉 www.lsu.edu/mns/files/ne...
Dan Sinopoli a analysé 55 spécimens de poisson-castors et orphies. L'un des spécimens scannés par #eCOL+ présentait les restes de son dernier repas!
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Proud to see #eCOL+ mentioned by the @lsu.bsky.social Museum of Natural Science for its assistance with the @mnhn.fr fish study 🐟
Dan Sinopoli analysed 55 specimens of bowfin and garfish. One of the specimens scanned by #eCOL+ showed the remains of its last meal!
👉 www.lsu.edu/mns/files/ne...
Dan Sinopoli analysed 55 specimens of bowfin and garfish. One of the specimens scanned by #eCOL+ showed the remains of its last meal!
👉 www.lsu.edu/mns/files/ne...
October 26, 2025 at 2:45 PM
Proud to see #eCOL+ mentioned by the @lsu.bsky.social Museum of Natural Science for its assistance with the @mnhn.fr fish study 🐟
Dan Sinopoli analysed 55 specimens of bowfin and garfish. One of the specimens scanned by #eCOL+ showed the remains of its last meal!
👉 www.lsu.edu/mns/files/ne...
Dan Sinopoli analysed 55 specimens of bowfin and garfish. One of the specimens scanned by #eCOL+ showed the remains of its last meal!
👉 www.lsu.edu/mns/files/ne...
"#Biodiversité & #IA" de l’INEE @cnrsecologie.bsky.social a réuni +190 personnes pour explorer les apports de l’IA à la recherche sur la biodiversité.
Le projet #eCOL+ était bien représenté
🎤 R. Vignes-Lebbe – IA & Texte
🎤 N. Navarro – IA & Image
🧠 C. Guillaumot – Deep Learning et landmarks 3D
Le projet #eCOL+ était bien représenté
🎤 R. Vignes-Lebbe – IA & Texte
🎤 N. Navarro – IA & Image
🧠 C. Guillaumot – Deep Learning et landmarks 3D
October 24, 2025 at 6:44 PM
"#Biodiversité & #IA" de l’INEE @cnrsecologie.bsky.social a réuni +190 personnes pour explorer les apports de l’IA à la recherche sur la biodiversité.
Le projet #eCOL+ était bien représenté
🎤 R. Vignes-Lebbe – IA & Texte
🎤 N. Navarro – IA & Image
🧠 C. Guillaumot – Deep Learning et landmarks 3D
Le projet #eCOL+ était bien représenté
🎤 R. Vignes-Lebbe – IA & Texte
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Wow, nature is too cool! Structures on stinkbug hind legs that used to be interpreted as ears are actually chambers with fungi. The bugs coat their eggs in those fungi to protect them against parasitoid wasps. 🧪
Defensive fungal symbiosis on insect hindlegs | Science www.science.org/doi/10.1126/...
Defensive fungal symbiosis on insect hindlegs | Science www.science.org/doi/10.1126/...
Defensive fungal symbiosis on insect hindlegs
Dinidorid stinkbugs were reported to possess a conspicuous tympanal organ on female hindlegs. In this study, we show that this organ is specialized to retain microbial symbionts rather than to perceiv...
www.science.org
October 17, 2025 at 4:42 PM
Wow, nature is too cool! Structures on stinkbug hind legs that used to be interpreted as ears are actually chambers with fungi. The bugs coat their eggs in those fungi to protect them against parasitoid wasps. 🧪
Defensive fungal symbiosis on insect hindlegs | Science www.science.org/doi/10.1126/...
Defensive fungal symbiosis on insect hindlegs | Science www.science.org/doi/10.1126/...
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Added a few newly collected Ichneumon species to Ichneumonids of North America. Amazingly, I've found 31 different species based on females when records only show 4 for the state! Compare that with 57 species in Main, which is probably a fairly complete inventory.
#entomology #newspecies #taxonomy
#entomology #newspecies #taxonomy
October 17, 2025 at 5:21 PM
Added a few newly collected Ichneumon species to Ichneumonids of North America. Amazingly, I've found 31 different species based on females when records only show 4 for the state! Compare that with 57 species in Main, which is probably a fairly complete inventory.
#entomology #newspecies #taxonomy
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A few behind-the-scenes photos of Minimalist Coryphodon. After a couple colleagues expressed disappointment that our “giant” of the Paleocene wasn’t all that giant, I pushed for a more agro pose.
I wanted visitors to leave understanding that an animal this size could easily crush them!
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September 13, 2025 at 2:39 PM
A few behind-the-scenes photos of Minimalist Coryphodon. After a couple colleagues expressed disappointment that our “giant” of the Paleocene wasn’t all that giant, I pushed for a more agro pose.
I wanted visitors to leave understanding that an animal this size could easily crush them!
I wanted visitors to leave understanding that an animal this size could easily crush them!
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I’m (finally) reading about Dynastinae morphological character and I stumbled upon Guillaume-Antoine Olivier, who described many species such as Megasoma gyas... in 1789 and in the following years.
I like to imagine the guy "Yeah France is on fire rn but I’m going to describe my insects tyvm"
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September 26, 2025 at 4:45 PM
I’m (finally) reading about Dynastinae morphological character and I stumbled upon Guillaume-Antoine Olivier, who described many species such as Megasoma gyas... in 1789 and in the following years.
I like to imagine the guy "Yeah France is on fire rn but I’m going to describe my insects tyvm"
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- the #digitization of French natural history #collections
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e-COL+ Numérisation 3D des collections naturalistes.
Projet e-COL+ Numérisation 3D des collections naturalistes a bénéficié d'une aide de l’État PIA3-ANR-21-ESRE-0053
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September 3, 2025 at 8:51 AM
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Le site www.ecolplus.fr fait peau neuve ✨
Vous y trouverez :
- une présentation du projet de #numérisation des #collections naturalistes françaises
- les équipements disponibles
- les partenaires impliqués
Et nouveauté : une page dédiée à toutes nos actualités !
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e-COL+ Numérisation 3D des collections naturalistes.
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September 3, 2025 at 8:50 AM
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Le @mnhn.fr a organisé les #Journées3D.
2 jours pour discuter des données issues de la numérisation 3D des spécimens naturalistes :
- pour la #recherche
- pour les #collections naturalistes
- pour la gestion de ces données
Retrouver l'intégralité des présentations ici :
youtube.com/playlist?lis...
2 jours pour discuter des données issues de la numérisation 3D des spécimens naturalistes :
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JOURNEE 3D Produire, analyser, gérer et diffuser les données 3D dans les sciences naturelles : de la conservation des collection naturalistes aux beso - YouTube
Auditorium de la Grande Galerie de l'Evolution, Muséum national d'Histoire naturelle – les 29 et 30/01/2025
youtube.com
August 4, 2025 at 5:18 PM
Le @mnhn.fr a organisé les #Journées3D.
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I used my 3D printer to create educational anatomical models of the brains of fish, frog, & lizard 🐟🐸🦎 The (color-blind friendly) colors demonstrate anatomical regions, and the 🧠 are many times larger than their real size. They can be removed from their stands for closer examination/comparison 🧪
June 26, 2025 at 3:56 PM
I used my 3D printer to create educational anatomical models of the brains of fish, frog, & lizard 🐟🐸🦎 The (color-blind friendly) colors demonstrate anatomical regions, and the 🧠 are many times larger than their real size. They can be removed from their stands for closer examination/comparison 🧪
Congrats to Camille Berruyer and the NOVITOM team, who presented their poster at #Technart:
4000 arthropod specimens from @mnhn.fr are being digitized using synchrotron microCT at @esrf.fr , with a high-throughput pipeline developed for #e-COL+.
#OpenScience
#3DImaging
4000 arthropod specimens from @mnhn.fr are being digitized using synchrotron microCT at @esrf.fr , with a high-throughput pipeline developed for #e-COL+.
#OpenScience
#3DImaging
May 18, 2025 at 2:01 PM
Congrats to Camille Berruyer and the NOVITOM team, who presented their poster at #Technart:
4000 arthropod specimens from @mnhn.fr are being digitized using synchrotron microCT at @esrf.fr , with a high-throughput pipeline developed for #e-COL+.
#OpenScience
#3DImaging
4000 arthropod specimens from @mnhn.fr are being digitized using synchrotron microCT at @esrf.fr , with a high-throughput pipeline developed for #e-COL+.
#OpenScience
#3DImaging
ScanAllTypes: 362 fish types digitized in 3D, thanks to the operators (👋 @m0neverest.bsky.social , @morganproust.bsky.social et K. Leblanc) and to the ichthyology collection team.
A unique expertise in X-ray tomography, to preserve and share the @mnhn.fr's heritage.
#OpenScience
A unique expertise in X-ray tomography, to preserve and share the @mnhn.fr's heritage.
#OpenScience
May 18, 2025 at 1:44 PM
ScanAllTypes: 362 fish types digitized in 3D, thanks to the operators (👋 @m0neverest.bsky.social , @morganproust.bsky.social et K. Leblanc) and to the ichthyology collection team.
A unique expertise in X-ray tomography, to preserve and share the @mnhn.fr's heritage.
#OpenScience
A unique expertise in X-ray tomography, to preserve and share the @mnhn.fr's heritage.
#OpenScience
362 types de poissons numérisés en 3D grâce aux opérateurs (👋 @m0neverest.bsky.social, @morganproust.bsky.social et K. Leblanc) et aux équipes des collections d'ichtyologie.
Un savoir-faire unique en tomo à rayons X, développé pour préserver et partager le patrimoine du @mnhn.fr. #ScienceOuverte
Un savoir-faire unique en tomo à rayons X, développé pour préserver et partager le patrimoine du @mnhn.fr. #ScienceOuverte
May 18, 2025 at 1:40 PM
362 types de poissons numérisés en 3D grâce aux opérateurs (👋 @m0neverest.bsky.social, @morganproust.bsky.social et K. Leblanc) et aux équipes des collections d'ichtyologie.
Un savoir-faire unique en tomo à rayons X, développé pour préserver et partager le patrimoine du @mnhn.fr. #ScienceOuverte
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La deadline approche (30 avril)
N'hésitez pas à envoyer votre candidature si vous voulez participer au projet e-COL+ en tant qu'operateur.ice de numérisation
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#JobAlert!
Nous cherchons un opérateur de numérisation pour le projet e-COL+.
Si vous avez de l'expérience avec la numérisation 3D (acquisition ou post-traitement) et avec les collections naturalistes, n'hésitez pas à postuler : recrutement.mnhn.fr/front-jobs-d...
🗓️ Deadline : 30 avril 2025
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Si vous avez de l'expérience avec la numérisation 3D (acquisition ou post-traitement) et avec les collections naturalistes, n'hésitez pas à postuler : recrutement.mnhn.fr/front-jobs-d...
🗓️ Deadline : 30 avril 2025
Technicien de collection spécialisé en numérisation 3D (F/H) @ Muséum national d'Histoire naturelle
Muséum national d'Histoire naturellerecrute !
recrutement.mnhn.fr
April 16, 2025 at 5:32 PM
La deadline approche (30 avril)
N'hésitez pas à envoyer votre candidature si vous voulez participer au projet e-COL+ en tant qu'operateur.ice de numérisation
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Reposted by e-COL+
L'occasion de découvrir que les numérisations 3D sont diffusées sous licence libre. Déjà 14000 fichiers proposés ! #ScienceOuverte
#JobAlert!
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🗓️ Deadline : 30 avril 2025
Technicien de collection spécialisé en numérisation 3D (F/H) @ Muséum national d'Histoire naturelle
Muséum national d'Histoire naturellerecrute !
recrutement.mnhn.fr
March 29, 2025 at 9:38 AM
L'occasion de découvrir que les numérisations 3D sont diffusées sous licence libre. Déjà 14000 fichiers proposés ! #ScienceOuverte
#JobAlert!
Nous cherchons un opérateur de numérisation pour le projet e-COL+.
Si vous avez de l'expérience avec la numérisation 3D (acquisition ou post-traitement) et avec les collections naturalistes, n'hésitez pas à postuler : recrutement.mnhn.fr/front-jobs-d...
🗓️ Deadline : 30 avril 2025
Nous cherchons un opérateur de numérisation pour le projet e-COL+.
Si vous avez de l'expérience avec la numérisation 3D (acquisition ou post-traitement) et avec les collections naturalistes, n'hésitez pas à postuler : recrutement.mnhn.fr/front-jobs-d...
🗓️ Deadline : 30 avril 2025
Technicien de collection spécialisé en numérisation 3D (F/H) @ Muséum national d'Histoire naturelle
Muséum national d'Histoire naturellerecrute !
recrutement.mnhn.fr
March 28, 2025 at 7:12 PM
#JobAlert!
Nous cherchons un opérateur de numérisation pour le projet e-COL+.
Si vous avez de l'expérience avec la numérisation 3D (acquisition ou post-traitement) et avec les collections naturalistes, n'hésitez pas à postuler : recrutement.mnhn.fr/front-jobs-d...
🗓️ Deadline : 30 avril 2025
Nous cherchons un opérateur de numérisation pour le projet e-COL+.
Si vous avez de l'expérience avec la numérisation 3D (acquisition ou post-traitement) et avec les collections naturalistes, n'hésitez pas à postuler : recrutement.mnhn.fr/front-jobs-d...
🗓️ Deadline : 30 avril 2025
Reposted by e-COL+
Heading to the beautiful Villa Vigoni in #Italy for the second workshop on "Digitisation of Natural History Collections in Europe between Humanities and Natural Sciences" to present the @e-colplus.bsky.social project and reflect on numerical collections.
www.villavigoni.eu
www.villavigoni.eu
Villa Vigoni | Centro italo-tedesco per il dialogo europeo
Home - Villa Vigoni | Centro italo-tedesco per il dialogo europeo - Un laboratorio di idee, un punto di riferimento del dialogo e della collaborazione tra Italia e Germania nel contesto europeo. -
www.villavigoni.eu
March 24, 2025 at 5:45 AM
Heading to the beautiful Villa Vigoni in #Italy for the second workshop on "Digitisation of Natural History Collections in Europe between Humanities and Natural Sciences" to present the @e-colplus.bsky.social project and reflect on numerical collections.
www.villavigoni.eu
www.villavigoni.eu
Reposted by e-COL+
You can now browse through Sorbonne Université's scientific collections' catalogues (including medical collections). They started working on this 4 years ago: colluniv.sorbonne-universite.fr
SorbonNum+
colluniv.sorbonne-universite.fr
March 18, 2025 at 9:16 AM
You can now browse through Sorbonne Université's scientific collections' catalogues (including medical collections). They started working on this 4 years ago: colluniv.sorbonne-universite.fr
The #e-COL+ project is also digitizing @mnhn.fr arthropod collections 🐛🪰🪳using advanced imaging!
For specimens <1 cm, Novitom (www.novitom.com/fr/) captures high-res CT-scans at @esrf.fr #Synchrotron, revealing stunning details—like this 3mm 𝘿𝙖𝙘𝙣𝙚 𝙗𝙞𝙥𝙪𝙨𝙩𝙪𝙡𝙖𝙩𝙖 🪲!
www.youtube.com/watch?v=ju_f...
For specimens <1 cm, Novitom (www.novitom.com/fr/) captures high-res CT-scans at @esrf.fr #Synchrotron, revealing stunning details—like this 3mm 𝘿𝙖𝙘𝙣𝙚 𝙗𝙞𝙥𝙪𝙨𝙩𝙪𝙡𝙖𝙩𝙖 🪲!
www.youtube.com/watch?v=ju_f...
3D non destructive imaging of an insect
YouTube video by Novitom
www.youtube.com
February 26, 2025 at 10:32 AM
The #e-COL+ project is also digitizing @mnhn.fr arthropod collections 🐛🪰🪳using advanced imaging!
For specimens <1 cm, Novitom (www.novitom.com/fr/) captures high-res CT-scans at @esrf.fr #Synchrotron, revealing stunning details—like this 3mm 𝘿𝙖𝙘𝙣𝙚 𝙗𝙞𝙥𝙪𝙨𝙩𝙪𝙡𝙖𝙩𝙖 🪲!
www.youtube.com/watch?v=ju_f...
For specimens <1 cm, Novitom (www.novitom.com/fr/) captures high-res CT-scans at @esrf.fr #Synchrotron, revealing stunning details—like this 3mm 𝘿𝙖𝙘𝙣𝙚 𝙗𝙞𝙥𝙪𝙨𝙩𝙪𝙡𝙖𝙩𝙖 🪲!
www.youtube.com/watch?v=ju_f...
Reposted by e-COL+
After ct-scanning a school of fish with @killianleblanc and @m0neverest.bsky.social (more than 500 scans), the first amphibian I was lucky enough to scan for the @e-colplus.bsky.social !
Welcome to Quasipaa exilispinosa (MNHN_RA_1988.7891)!
@chrisdufresnes.bsky.social @paulineprovini.bsky.social
Welcome to Quasipaa exilispinosa (MNHN_RA_1988.7891)!
@chrisdufresnes.bsky.social @paulineprovini.bsky.social
February 14, 2025 at 10:30 PM
After ct-scanning a school of fish with @killianleblanc and @m0neverest.bsky.social (more than 500 scans), the first amphibian I was lucky enough to scan for the @e-colplus.bsky.social !
Welcome to Quasipaa exilispinosa (MNHN_RA_1988.7891)!
@chrisdufresnes.bsky.social @paulineprovini.bsky.social
Welcome to Quasipaa exilispinosa (MNHN_RA_1988.7891)!
@chrisdufresnes.bsky.social @paulineprovini.bsky.social
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Bugs of the day: the amazing preponini!
January 27, 2025 at 5:51 PM
Bugs of the day: the amazing preponini!