Não tem lógica mas é replicado, isso que me incomoda. E pior, a referência deve ser essa entrada da ABL que você citou🫠 Eu disse que missoshiru é aceitável porque em japonês você não vai encontrar みっそ, é みそ. Sopa de missô não vejo problema também, depende muito do público que se quer atingir.

Eu não sei de onde vem esse missoshiro (vi muito em literatura, talvez por essa entrada na ABL), mas os produtos usam U. Então não sei se é uma grafia consagrada pelo uso comercial.

As pessoas replicam missoshiro porque acham que está certo. É papel de quem sabe o idioma avisar que essa não é a transliteração do japonês e oferecer uma opção para que ela use misoshiru ou missoshiru. A língua é viva, vai que um dia temos "xoiu" e "suxi" por aí.