Alejandro Rodríguez Martínez
@alrodriguezm.bsky.social
PhD student funded by the AECC at UCAM
Y ahora sí, me despido, no sin antes daros las gracias por llegar hasta aquí. 🙏
Espero que os haya gustado la historia y que hayáis aprendido mucho sobre el fascinante proceso de descubrimiento de fármacos asistido por ordenador.
¡Hasta pronto! 👋🤖
Espero que os haya gustado la historia y que hayáis aprendido mucho sobre el fascinante proceso de descubrimiento de fármacos asistido por ordenador.
¡Hasta pronto! 👋🤖
June 13, 2025 at 3:21 PM
Y ahora sí, me despido, no sin antes daros las gracias por llegar hasta aquí. 🙏
Espero que os haya gustado la historia y que hayáis aprendido mucho sobre el fascinante proceso de descubrimiento de fármacos asistido por ordenador.
¡Hasta pronto! 👋🤖
Espero que os haya gustado la historia y que hayáis aprendido mucho sobre el fascinante proceso de descubrimiento de fármacos asistido por ordenador.
¡Hasta pronto! 👋🤖
Bueno… ¡La verdad es que ya nos hemos puesto a ello! 😉
Actualmente estamos aplicándola en este tipo de problemas, y esperamos obtener resultados increíbles muy pronto.
Actualmente estamos aplicándola en este tipo de problemas, y esperamos obtener resultados increíbles muy pronto.
a close up of a person 's face with flames coming out of it 's mouth .
ALT: a close up of a person 's face with flames coming out of it 's mouth .
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June 13, 2025 at 3:21 PM
Bueno… ¡La verdad es que ya nos hemos puesto a ello! 😉
Actualmente estamos aplicándola en este tipo de problemas, y esperamos obtener resultados increíbles muy pronto.
Actualmente estamos aplicándola en este tipo de problemas, y esperamos obtener resultados increíbles muy pronto.
Y no nos podemos olvidar de la Inteligencia Artificial, que ahora está en pleno auge.
¿Por qué no pedirle que nos eche una mano para mejorar nuestras expediciones y predecir mejores moléculas en el futuro?
¿Por qué no pedirle que nos eche una mano para mejorar nuestras expediciones y predecir mejores moléculas en el futuro?
a picture of a robot with the words " the machines are taking over " on it
ALT: a picture of a robot with the words " the machines are taking over " on it
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June 13, 2025 at 3:21 PM
Y no nos podemos olvidar de la Inteligencia Artificial, que ahora está en pleno auge.
¿Por qué no pedirle que nos eche una mano para mejorar nuestras expediciones y predecir mejores moléculas en el futuro?
¿Por qué no pedirle que nos eche una mano para mejorar nuestras expediciones y predecir mejores moléculas en el futuro?
En estos casos, claro… nos tocará volver a explorar este universo u otros, en busca de esa nueva molécula ideal. 🚀
Pero lo bueno es que ya hicimos el viaje una vez.
Tenemos el cohete listo, y toda la experiencia acumulada para lanzarnos a por otros desafíos. Esta vez, será mucho más llevadero.
Pero lo bueno es que ya hicimos el viaje una vez.
Tenemos el cohete listo, y toda la experiencia acumulada para lanzarnos a por otros desafíos. Esta vez, será mucho más llevadero.
a screenshot of a video game shows a steering wheel and a monitor
ALT: a screenshot of a video game shows a steering wheel and a monitor
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June 13, 2025 at 3:21 PM
En estos casos, claro… nos tocará volver a explorar este universo u otros, en busca de esa nueva molécula ideal. 🚀
Pero lo bueno es que ya hicimos el viaje una vez.
Tenemos el cohete listo, y toda la experiencia acumulada para lanzarnos a por otros desafíos. Esta vez, será mucho más llevadero.
Pero lo bueno es que ya hicimos el viaje una vez.
Tenemos el cohete listo, y toda la experiencia acumulada para lanzarnos a por otros desafíos. Esta vez, será mucho más llevadero.
Además, por ahora le ha tocado recibir a Spiderman… Pero desgraciadamente aún quedan muchos más villanos que ayudan al cáncer a prosperar.
Cuantos más logremos detener, más eficaces serán los tratamientos. Ya tenemos algunas nuevas proteínas candidatas.
¡Así que más les vale estar preparadas! 💪
Cuantos más logremos detener, más eficaces serán los tratamientos. Ya tenemos algunas nuevas proteínas candidatas.
¡Así que más les vale estar preparadas! 💪
three cartoon characters are posing for a picture and one of them has a star on his head
ALT: three cartoon characters are posing for a picture and one of them has a star on his head
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June 13, 2025 at 3:21 PM
Además, por ahora le ha tocado recibir a Spiderman… Pero desgraciadamente aún quedan muchos más villanos que ayudan al cáncer a prosperar.
Cuantos más logremos detener, más eficaces serán los tratamientos. Ya tenemos algunas nuevas proteínas candidatas.
¡Así que más les vale estar preparadas! 💪
Cuantos más logremos detener, más eficaces serán los tratamientos. Ya tenemos algunas nuevas proteínas candidatas.
¡Así que más les vale estar preparadas! 💪
Pero esto no acaba aquí. Antes de despedirme, me gustaría hablaros de los siguientes pasos hacia los que avanzamos.
Aún quedan muchas más moléculas por explorar, y puede que alguna funcione incluso mejor que esta.
Así que este arco de la historia todavía no está cerrado… ni mucho menos.
Aún quedan muchas más moléculas por explorar, y puede que alguna funcione incluso mejor que esta.
Así que este arco de la historia todavía no está cerrado… ni mucho menos.
a close up of a sign that says tinui
ALT: a close up of a sign that says tinui
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June 13, 2025 at 3:21 PM
Pero esto no acaba aquí. Antes de despedirme, me gustaría hablaros de los siguientes pasos hacia los que avanzamos.
Aún quedan muchas más moléculas por explorar, y puede que alguna funcione incluso mejor que esta.
Así que este arco de la historia todavía no está cerrado… ni mucho menos.
Aún quedan muchas más moléculas por explorar, y puede que alguna funcione incluso mejor que esta.
Así que este arco de la historia todavía no está cerrado… ni mucho menos.
Así que, tras nuestro viaje por ordenador al extenso espacio químico, y los experimentos en el laboratorio…
Conseguimos una molécula que no solo bloquea la fascina, sino que es diferente a otras bloqueadoras previas.
Nuestra molécula única, capaz de reducir la migración y proliferación del tumor.
Conseguimos una molécula que no solo bloquea la fascina, sino que es diferente a otras bloqueadoras previas.
Nuestra molécula única, capaz de reducir la migración y proliferación del tumor.
a close up of a ring with writing on it and the words `` one ring to rule them all '' .
ALT: a close up of a ring with writing on it and the words `` one ring to rule them all '' .
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June 13, 2025 at 3:21 PM
Así que, tras nuestro viaje por ordenador al extenso espacio químico, y los experimentos en el laboratorio…
Conseguimos una molécula que no solo bloquea la fascina, sino que es diferente a otras bloqueadoras previas.
Nuestra molécula única, capaz de reducir la migración y proliferación del tumor.
Conseguimos una molécula que no solo bloquea la fascina, sino que es diferente a otras bloqueadoras previas.
Nuestra molécula única, capaz de reducir la migración y proliferación del tumor.
¡Eureka! 🙌 Al aplicar nuestra molécula a las células del tumor, comprobamos que estas dejaban de desplazarse.
Es decir: ¡bloqueamos los lanzatelarañas de la fascina! 🕸️🚫
Es decir: ¡bloqueamos los lanzatelarañas de la fascina! 🕸️🚫
June 13, 2025 at 3:21 PM
¡Eureka! 🙌 Al aplicar nuestra molécula a las células del tumor, comprobamos que estas dejaban de desplazarse.
Es decir: ¡bloqueamos los lanzatelarañas de la fascina! 🕸️🚫
Es decir: ¡bloqueamos los lanzatelarañas de la fascina! 🕸️🚫
Ahora nos desplazamos al laboratorio… esta vez sin ordenadores, a uno más convencional.
Allí nuestros colaboradores (a quienes aprovecho para dar las gracias 🙏) realizaron pruebas tanto en la proteína como en células del tumor para validar si esta molécula era la elegida.
Y lo que vimos fue que…
Allí nuestros colaboradores (a quienes aprovecho para dar las gracias 🙏) realizaron pruebas tanto en la proteína como en células del tumor para validar si esta molécula era la elegida.
Y lo que vimos fue que…
June 13, 2025 at 3:21 PM
Ahora nos desplazamos al laboratorio… esta vez sin ordenadores, a uno más convencional.
Allí nuestros colaboradores (a quienes aprovecho para dar las gracias 🙏) realizaron pruebas tanto en la proteína como en células del tumor para validar si esta molécula era la elegida.
Y lo que vimos fue que…
Allí nuestros colaboradores (a quienes aprovecho para dar las gracias 🙏) realizaron pruebas tanto en la proteína como en células del tumor para validar si esta molécula era la elegida.
Y lo que vimos fue que…
Además, también hicimos simulaciones para estudiar en qué zona exacta de la fascina se unía nuestra molécula.
Queríamos comprobar si se colocaba justamente en los lanzatelarañas de Spiderman.
Esto es lo que se conoce como docking molecular.
Queríamos comprobar si se colocaba justamente en los lanzatelarañas de Spiderman.
Esto es lo que se conoce como docking molecular.
June 13, 2025 at 3:21 PM
Además, también hicimos simulaciones para estudiar en qué zona exacta de la fascina se unía nuestra molécula.
Queríamos comprobar si se colocaba justamente en los lanzatelarañas de Spiderman.
Esto es lo que se conoce como docking molecular.
Queríamos comprobar si se colocaba justamente en los lanzatelarañas de Spiderman.
Esto es lo que se conoce como docking molecular.
Así fue como encontramos una molécula con esas características. De nombre bastante largo, por cierto… Z1362873773.
Comprobamos que tenía un perfil farmacológico muy similar a nuestra molécula de referencia como se puede ver en la imagen de justo debajo.
Comprobamos que tenía un perfil farmacológico muy similar a nuestra molécula de referencia como se puede ver en la imagen de justo debajo.
June 13, 2025 at 3:21 PM
Así fue como encontramos una molécula con esas características. De nombre bastante largo, por cierto… Z1362873773.
Comprobamos que tenía un perfil farmacológico muy similar a nuestra molécula de referencia como se puede ver en la imagen de justo debajo.
Comprobamos que tenía un perfil farmacológico muy similar a nuestra molécula de referencia como se puede ver en la imagen de justo debajo.
En nuestro caso, escogimos una molécula que ya bloqueaba en cierto grado a nuestra proteína “Spiderman”.
A partir de ella, comenzamos la búsqueda de otras moléculas en distintos espacios químicos, con miles o millones de compuestos, que pudieran tener un efecto similar… o incluso mejor. 🕷️🔍
A partir de ella, comenzamos la búsqueda de otras moléculas en distintos espacios químicos, con miles o millones de compuestos, que pudieran tener un efecto similar… o incluso mejor. 🕷️🔍
a cartoon of two spidermans standing in front of a nypd van
ALT: a cartoon of two spidermans standing in front of a nypd van
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June 13, 2025 at 3:21 PM
En nuestro caso, escogimos una molécula que ya bloqueaba en cierto grado a nuestra proteína “Spiderman”.
A partir de ella, comenzamos la búsqueda de otras moléculas en distintos espacios químicos, con miles o millones de compuestos, que pudieran tener un efecto similar… o incluso mejor. 🕷️🔍
A partir de ella, comenzamos la búsqueda de otras moléculas en distintos espacios químicos, con miles o millones de compuestos, que pudieran tener un efecto similar… o incluso mejor. 🕷️🔍
Nuestra primera hoja de ruta fue buscar una molécula de referencia que nos sirviera de guía.
Al igual que si buscáramos planetas habitables, lo lógico sería empezar observando al único que conocemos: la Tierra. 🌍
Y así empezamos a tirar del hilo… (nunca mejor dicho).
Al igual que si buscáramos planetas habitables, lo lógico sería empezar observando al único que conocemos: la Tierra. 🌍
Y así empezamos a tirar del hilo… (nunca mejor dicho).
June 13, 2025 at 3:21 PM
Nuestra primera hoja de ruta fue buscar una molécula de referencia que nos sirviera de guía.
Al igual que si buscáramos planetas habitables, lo lógico sería empezar observando al único que conocemos: la Tierra. 🌍
Y así empezamos a tirar del hilo… (nunca mejor dicho).
Al igual que si buscáramos planetas habitables, lo lógico sería empezar observando al único que conocemos: la Tierra. 🌍
Y así empezamos a tirar del hilo… (nunca mejor dicho).
Ahora que tenemos nuestra nave para explorar el universo molecular lista.
Es el momento de despegar y encontrar esa molécula ideal que estamos buscando para combatir a Spiderman. 🚀🕷️
Es el momento de despegar y encontrar esa molécula ideal que estamos buscando para combatir a Spiderman. 🚀🕷️
han solo and chewbacca are looking out the window of a spaceship
ALT: han solo and chewbacca are looking out the window of a spaceship
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June 13, 2025 at 3:21 PM
Ahora que tenemos nuestra nave para explorar el universo molecular lista.
Es el momento de despegar y encontrar esa molécula ideal que estamos buscando para combatir a Spiderman. 🚀🕷️
Es el momento de despegar y encontrar esa molécula ideal que estamos buscando para combatir a Spiderman. 🚀🕷️
Así que lo que hacemos es enviar todos los cálculos complejos que necesitamos a un SUPERCOMPUTADOR. 🧠💻
Tiene muchísimo más potencial que nuestro pobre ordenador de andar por casa, y puede hacer millones de cálculos que el nuestro ni soñaría.
Tiene muchísimo más potencial que nuestro pobre ordenador de andar por casa, y puede hacer millones de cálculos que el nuestro ni soñaría.
June 13, 2025 at 3:21 PM
Así que lo que hacemos es enviar todos los cálculos complejos que necesitamos a un SUPERCOMPUTADOR. 🧠💻
Tiene muchísimo más potencial que nuestro pobre ordenador de andar por casa, y puede hacer millones de cálculos que el nuestro ni soñaría.
Tiene muchísimo más potencial que nuestro pobre ordenador de andar por casa, y puede hacer millones de cálculos que el nuestro ni soñaría.
Y es que NO usamos el ordenador que muchos estaréis imaginando.
Para explorar un universo tan inmenso como el de las moléculas, necesitamos algo mucho más grande y potente. 🚀
No vale con el portátil donde vemos Netflix.
Para explorar un universo tan inmenso como el de las moléculas, necesitamos algo mucho más grande y potente. 🚀
No vale con el portátil donde vemos Netflix.
June 13, 2025 at 3:21 PM
Y es que NO usamos el ordenador que muchos estaréis imaginando.
Para explorar un universo tan inmenso como el de las moléculas, necesitamos algo mucho más grande y potente. 🚀
No vale con el portátil donde vemos Netflix.
Para explorar un universo tan inmenso como el de las moléculas, necesitamos algo mucho más grande y potente. 🚀
No vale con el portátil donde vemos Netflix.
¡Pero no os preocupéis! Tenemos una solución para evitar este problema de dimensiones universales.
Y aquí es donde entra esa parte de ordenadores y computación que os prometí al principio.
Aunque… os seré sincero: al inicio del hilo, os conté una pequeña mentira. 😅
Y aquí es donde entra esa parte de ordenadores y computación que os prometí al principio.
Aunque… os seré sincero: al inicio del hilo, os conté una pequeña mentira. 😅
how to build a liar is written on the blue background
ALT: how to build a liar is written on the blue background
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June 13, 2025 at 3:21 PM
¡Pero no os preocupéis! Tenemos una solución para evitar este problema de dimensiones universales.
Y aquí es donde entra esa parte de ordenadores y computación que os prometí al principio.
Aunque… os seré sincero: al inicio del hilo, os conté una pequeña mentira. 😅
Y aquí es donde entra esa parte de ordenadores y computación que os prometí al principio.
Aunque… os seré sincero: al inicio del hilo, os conté una pequeña mentira. 😅
Pero Alejandro… si hay moléculas por todas partes en la naturaleza, ¡debe de haber millones! ¿Cómo vamos a encontrar justo la que necesitamos para detener a la fascina?
Tenéis razón, sería como buscar un planeta habitable por todo el universo… !Viajando uno por uno! 🌌🪐
Tenéis razón, sería como buscar un planeta habitable por todo el universo… !Viajando uno por uno! 🌌🪐
a beam of light is coming out of a dark space
ALT: a beam of light is coming out of a dark space
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June 13, 2025 at 3:21 PM
Pero Alejandro… si hay moléculas por todas partes en la naturaleza, ¡debe de haber millones! ¿Cómo vamos a encontrar justo la que necesitamos para detener a la fascina?
Tenéis razón, sería como buscar un planeta habitable por todo el universo… !Viajando uno por uno! 🌌🪐
Tenéis razón, sería como buscar un planeta habitable por todo el universo… !Viajando uno por uno! 🌌🪐
¿Qué es exactamente una molécula? ¿De qué estás hablando?
Bueno, podríamos decir que son unidades minúsculas que forman todo lo que nos rodea: la naturaleza, el universo… ¡y hasta a nosotros mismos!
Si viviéramos en un universo LEGO, cada molécula sería una de esas piezas que lo construyen. 🧱✨
Bueno, podríamos decir que son unidades minúsculas que forman todo lo que nos rodea: la naturaleza, el universo… ¡y hasta a nosotros mismos!
Si viviéramos en un universo LEGO, cada molécula sería una de esas piezas que lo construyen. 🧱✨
a bunch of colorful lego bricks on a green surface
ALT: a bunch of colorful lego bricks on a green surface
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June 13, 2025 at 3:21 PM
¿Qué es exactamente una molécula? ¿De qué estás hablando?
Bueno, podríamos decir que son unidades minúsculas que forman todo lo que nos rodea: la naturaleza, el universo… ¡y hasta a nosotros mismos!
Si viviéramos en un universo LEGO, cada molécula sería una de esas piezas que lo construyen. 🧱✨
Bueno, podríamos decir que son unidades minúsculas que forman todo lo que nos rodea: la naturaleza, el universo… ¡y hasta a nosotros mismos!
Si viviéramos en un universo LEGO, cada molécula sería una de esas piezas que lo construyen. 🧱✨
Ahora que conocemos a nuestro villano, ¿qué podemos hacer para detenerlo y evitar que el tumor se escape de nuestro control?
Nuestro objetivo será encontrar algo que bloquee sus lanzatelarañas y le impida invadir otras partes del cuerpo.
Ese “algo” es, nada más y nada menos, que una molécula.
Nuestro objetivo será encontrar algo que bloquee sus lanzatelarañas y le impida invadir otras partes del cuerpo.
Ese “algo” es, nada más y nada menos, que una molécula.
June 13, 2025 at 3:21 PM
Ahora que conocemos a nuestro villano, ¿qué podemos hacer para detenerlo y evitar que el tumor se escape de nuestro control?
Nuestro objetivo será encontrar algo que bloquee sus lanzatelarañas y le impida invadir otras partes del cuerpo.
Ese “algo” es, nada más y nada menos, que una molécula.
Nuestro objetivo será encontrar algo que bloquee sus lanzatelarañas y le impida invadir otras partes del cuerpo.
Ese “algo” es, nada más y nada menos, que una molécula.
Lo que hace tan peligrosa a esta proteína es su capacidad para generar “telarañas” 🕸️.
Telarañas que ayudan al tumor a escapar y moverse por el cuerpo, provocando metástasis y empeorando gravemente el pronóstico del cáncer.
Así que sí… en esta historia, Spiderman es el villano de la película 🕷️.
Telarañas que ayudan al tumor a escapar y moverse por el cuerpo, provocando metástasis y empeorando gravemente el pronóstico del cáncer.
Así que sí… en esta historia, Spiderman es el villano de la película 🕷️.
a close up of a person 's head in a dark room .
ALT: a close up of a person 's head in a dark room .
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June 13, 2025 at 3:21 PM
Lo que hace tan peligrosa a esta proteína es su capacidad para generar “telarañas” 🕸️.
Telarañas que ayudan al tumor a escapar y moverse por el cuerpo, provocando metástasis y empeorando gravemente el pronóstico del cáncer.
Así que sí… en esta historia, Spiderman es el villano de la película 🕷️.
Telarañas que ayudan al tumor a escapar y moverse por el cuerpo, provocando metástasis y empeorando gravemente el pronóstico del cáncer.
Así que sí… en esta historia, Spiderman es el villano de la película 🕷️.
Primero, dejadme presentaros a la protagonista de nuestra historia: la fascina.
En la imagen puede parecer inofensiva, pero nada más lejos de la realidad…
Esta proteína, presente en muchos cánceres colorrectales, juega un papel clave en el desarrollo de la metástasis.⚠️
En la imagen puede parecer inofensiva, pero nada más lejos de la realidad…
Esta proteína, presente en muchos cánceres colorrectales, juega un papel clave en el desarrollo de la metástasis.⚠️
June 13, 2025 at 3:21 PM
Primero, dejadme presentaros a la protagonista de nuestra historia: la fascina.
En la imagen puede parecer inofensiva, pero nada más lejos de la realidad…
Esta proteína, presente en muchos cánceres colorrectales, juega un papel clave en el desarrollo de la metástasis.⚠️
En la imagen puede parecer inofensiva, pero nada más lejos de la realidad…
Esta proteína, presente en muchos cánceres colorrectales, juega un papel clave en el desarrollo de la metástasis.⚠️
Antes de nada, me gustaría agradecer a @crueuniversidades.bsky.social, @filarramendi.bsky.social por lanzar esta iniciativa tan interesante y a mi universidad @ucam.edu por permitirme llevar a cabo esta tesis.
Ahora sí, ¡vamos a ello!
Ahora sí, ¡vamos a ello!
June 13, 2025 at 3:21 PM
Antes de nada, me gustaría agradecer a @crueuniversidades.bsky.social, @filarramendi.bsky.social por lanzar esta iniciativa tan interesante y a mi universidad @ucam.edu por permitirme llevar a cabo esta tesis.
Ahora sí, ¡vamos a ello!
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