Had a great time at the SEM Malacology Forum presenting two research projects — one poster on the restoration of the Piles River and an oral communication on the sequencing of Iberian freshwater molluscs. 🐚🌊 #Malacology #Biodiversity #Metabarcoding

To move from research to routine use, we propose a roadmap 🛣️ — focused on implementation in Spain, but adaptable to other regions.

Why do results differ between bulk, eDNA & morphology? 🤔

We show in our article concrete examples from our data of false positives, false negatives & other sources of variability — and propose solutions.

📊 See the summary in the table 👇

💧 eDNA from rivers gave the most divergent results vs. bulk metabarcoding & morphology ID.
👉 Same pattern seen in other studies, even with a different methodology.
⏳ The spatiotemporal scale of the eDNA signal is still unclear — we must understand it better before using it in routine biomonitoring.

In our NW Spain case study, we compared three complementary approaches:

🧪 Bulk (homogenized) tissue metabarcoding
💧 eDNA (water sample) metabarcoding
🔎 Traditional morphological ID

We examined false positives/negatives and other sources of variability driving discrepancies.

In just months, macroinvertebrates recolonised step by step.
📊 DNA metabarcoding + classical ID revealed a rapid shift from pioneer taxa to sensitive EPT groups (Ephemeroptera, Plecoptera, Trichoptera).
Good ecological status achieved in under 2 years!

Opening the bottom valves of the Matalavilla dam released the first ecological flows in half a century, breathing life back into the Valseco stream.
💧 A simple change, a huge ecological impact.

Esta tesis ha desarrollado como un Doctorado Industrial en colaboración con Taxus Medio Ambiente y @universidadoviedo.bsky.social. Y ha sido financiada por el Ministerio de Ciencia e Innovación y la agencia Sekuens del Principado de Asturias.
@crueuniversidades.bsky.social
@filarramendi.bsky.social

💡Para acabar identificamos todos los retos que tienen estas técnicas hasta su implementación efectiva en la península ibérica y planteamos un hoja de ruta para trabajar en solventarlos.

🐛En cuestión de dos años el arroyo Valseco recuperó la diversidad de Macroinvertebrados y alcanzó el estado "Bueno" en todos sus tramos.
Demostrando que la recuperación del caudal ecológico es una herramienta útil para devolver nuestros ríos a la vida. 😄

💦 En el estudio de restauración fluvial ¡buenas noticias!
Estudiamos cómo se recuperaba la comunidad de macroinvertebrados en río que llevaba más de 50 años SECO debido a la construcción de la Presa de Matalavilla (León) en 1967.
En Diciembre de 2020 el arroyo Valseco recuperó su caudal ecológico.

🔍 ¿Qué descubrimos?

- Todavía faltan por secuenciar el 21% de las especies de la península ibérica.

- El metabarcoding de muestras Bulk da resultados más cercanos a los métodos clásicos.

- El eDNA complementa: detecta especies diferentes, probablemente provenientes de tramos superiores del río.

📍 Aplicamos estas técnicas en más de 100 muestras de ríos del norte de España.
- Primero para secuenciar las especies una a una y tener secuencias de referencia.
- Después para comparar las diferentes metodologías.
- Incluso usamos un caso real de restauración fluvial en León.

🧬 ¿Y si usamos el ADN en vez de microscopios? He usado parte de su material genético a modo de código de barras (Metabarcoding) y dos tipos de muestras diferentes como fuente de ADN:

- Un batido de Macroinvertebrados (muestra Bulk).

- ADN ambiental (muestra eDNA) obtenido de filtrar agua del río.

🦟Los indicadores biológicos (organismos que viven en el agua) nos aportan mucha información sobre el estado del río. Uno de los grupos de organismos más utilizados son unos pequeños animales acuáticos llamados macroinvertebrados. El problema: identificarlos a ojo es lento, caro y complejo.

📖 La Directiva Directiva Marco del Agua 2000/60/CE estableció una normas para todos los estados miembros de la Unión Europea. Por la cual se evalúa el estado químico (Contaminantes) y el estado ecológico (elementos Fisicoquímicos, Hidromorfológicos, y lo más importante para esta tesis: Biológicos)

💧 Los ríos son esenciales: sostienen la biodiversidad y nos proveen de agua. Pero los últimos datos disponibles indican que menos de la mitad de los ríos europeos estaban en buen estado. ¿Cómo podemos saber su estado ecológico de forma fiable?

🧵 #HiloTesis | ¿Cómo se mide el estado de un río? ¿Puede el ADN decirnos si un río está sano?
¡Te cuento cómo he aplicado tecnologías basadas en ADN para evaluar la salud ecológica de los ríos en la Península Ibérica!