HORBEC are protein complexes involved in the regulation of redox balance and energy conservation. The authors develop a bioinformatic tool for HORBEC annotation in bacterial and archaeal genomes and r...

CR26-TRANSFORM-1 - Vous développerez votre recherche dans l'équipe Paroi Végétale et Polymères Pariétaux (PVPP) de l'unité Biopolymères Interactions Assemblages. L'unité BIA (160 personnes, 98 titulaires) génère des connaissances sur les biopolymères, leurs assemblages au sein des végétaux, leurs transformations et leurs fonctionnalités dans des applications alimentaires ou non.L'équipe PVPP (30 personnes, 14 titulaires), vise à comprendre i) les mécanismes biologiques et physico-chimiques qui pilotent les assemblages pariétaux chez les plantes, ii) les rôles de la paroi et de sa diversité dans les propriétés et les qualités d'usage des produits végétaux. Elle est bien identifiée et reconnue au niveau international pour ses compétences sur la variabilité et la qualité des ressources végétales en lien avec la paroi. Vous bénéficierez de la forte expertise d'un collectif scientifique spécialiste de la paroi végétale et bien impliqué dans des réseaux nationaux et internationaux, académiques et privés.La biomasse végétale est majoritairement constituée de parois végétales. A partir de cette ressource renouvelable, nos recherches visent à produire, par des voies durables, des bio-produits et matériaux substituant les ressources fossiles. Les propriétés d'usage des parois sont liées à leur composition en biopolymères, mais aussi à la présence de petites molécules dont le rôle est méconnu, ainsi qu'aux interactions entre tous ces composants pour former le réseau pariétal.Vous travaillerez sur ces espèces de faible masse molaire, qu'elles soient neutres ou ioniques, organiques (ex mono-oligosaccharides) et inorganiques (sels), et qu'elles aient un effet osmotique, réactif ou structural. Vous chercherez à élucider comment elles contribuent aux propriétés du réseau pariétal, quelles interactions elles établissent avec les polymères (polysaccharides, lignines, cutines, protéines), en relation avec la disponibilité et la mobilité de l'eau.Vous étudierez l'effet de la nature et de la concentration de différentes espèces solubles sur la mobilité des biopolymères, les propriétés ou l'accessibilité du réseau pariétal, afin d'appréhender leur impact sur les parois et à terme piloter leur transformation. Ces travaux vous permettront de comprendre et d'optimiser le comportement de la biomasse lors de procédés de fractionnement ou transformation, et de proposer des voies de valorisation pertinentes dans un contexte de bioéconomie (extraction par solubilisation sélective, saccharification…).Pour élucider le rôle des petites molécules dans le réseau pariétal, les différentes stratégies expérimentales possibles impliqueront i) l'identification, la quantification et la localisation de ces molécules de faible masse molaire, ii) la mesure des interactions entre ces molécules et des polymères pariétaux, qu'elles soient de nature covalente, ionique, hydrophobe, stérique…, iii) l'étude de la mobilité de l'eau et des polymères en présence de ces molécules sur des assemblages contrôlés, des parois isolées ou des tissus, iv) la mesure de différentes propriétés des tissus.A plus long terme, les données obtenues à l'interface entre les différents champs disciplinaires mis en œuvre vous permettront d'appréhender l'effet de ces petites molécules sur la dégradabilité des parois, l'extractabilité de composés d'intérêt, l'activité d'enzymes endogènes ou utilisées dans des procédés de transformation, ou encore la fonctionnalisation de polymères pariétaux.Vous disposerez d'équipements performants dédiés à la caractérisation des parois, de l'état de l'eau, de la structure des polymères et de leurs interactions, présents dans l'équipe et dans l'unité BIA. Vous aurez également accès aux plateformes de biologie structurale (BIBS, APEX) et aux lignes du synchrotron SOLEIL. Vous bénéficierez des collaborations nationales et internationales en place dans l'équipe sur les différents aspects de votre thématique. La mise en place de votre recherche sera supportée par les projets en cours portés par les chercheurs seniors de l'équipe (ANR, PEPR, FSOV, Horizon Europe…). Au-delà, vous développerez votre propre réseau de collaborations et soumettrez des demandes de soutien au sein de l'institut ainsi qu'aux guichets nationaux et internationaux.

We are looking for a Full Professor in the Biophysics chair group, part of Wageningen University & Research (WUR)

A DNA nanoruler platform enables precise measurement of the labeling radii of TurboID and APEX2, uncovering their contact-dependent mechanisms. These findings redefine the enzymology of proximity labe...

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